pydicom没有定义

Question

我正在尝试学习如何使用pydicom来阅读和处理dicom图片。我使用的是Python 3。

import dicom 
import numpy
ds = pydicom.read_file(lstFilesDCM[0])
print(ds.pixel_array)`

我收到错误NameError: name 'pydicom' is not defined。如果我改变

   ds = pydicom.read_file(lstFilesDCM[0])

到

   ds = dicom.read_file(lstFilesDCM[0])

（改为使用dicom.read_file），我收到以下错误：

NotImplementedError: Pixel Data is compressed in a format 
pydicom does not yet handle. Cannot return array

我还验证pydicom已正确安装和更新。

我该如何解决这个问题？

Answer 1

您正在尝试调用之前未导入的类：

使用：

import pydicom
import numpy


ds = pydicom.read_file(lstFilesDCM[0])
print(ds.pixel_array)

或

import dicom
ds = dicom.read_file("the_name_of_file.dcm")

文档：http://pydicom.readthedocs.io/en/stable/pydicom_user_guide.html

Answer 2

如果您想了解像素数据，我建议您使用ImageMagick套件中的myViewer.start(AWS_Url, opts) 程序。您可以使用convert模块从Python调用此程序。 （请参阅此example，我将其转换为JPEG格式），或者您可以使用其中一个Python bindings。

如果要操作图像，最好使用绑定。但请注意，并非所有绑定都已转换为ImageMagick版本7.