Python Pandas:计算可变行数的滚动均值(移动平均值)

时间:2017-11-24 22:53:46

标签: python pandas dataframe time-series moving-average

说我有以下数据框

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({ 'distance':[2.0, 3.0, 1.0, 4.0],
                    'velocity':[10.0, 20.0, 5.0, 40.0] })

给出数据框

   distance  velocity
0         2.0        10.0
1         3.0        20.0
2         1.0        5.0
3         4.0        40.0

如何计算距离列的滚动总和上的速度列的平均值?使用上面的示例,在最后N行上创建一个滚动总和,以获得最小累积距离5,然后计算这些行的平均速度。

我的目标输出将是这样的:

   distance  velocity    rv
0         2.0        10.0    NaN
1         3.0        20.0    15.0
2         1.0         5.0    11.7
3         4.0        40.0    22.5

,其中

15.0 = (10+20)/2        (2 because 3 + 2     >= 5)
11.7 = (10 + 20 + 5)/3  (3 because 1 + 3 + 2 >= 5) 
22.5 = (5 + 40)/2       (2 because 4 + 1     >= 5)

更新:在Pandas中,我的代码应该找到从当前记录返回的反向累积距离总和的索引(这样它是5或更大),然后使用该索引计算移动平均线的起点。

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

不是一个特别粗略的解决方案,但听起来你想要做像

这样的事情
df['rv'] = np.nan
for i in range(len(df)):
    j = i
    s = 0
    while j >= 0 and s < 5:
        s += df['distance'].loc[j]
        j -= 1
    if s >= 5:
        df['rv'].loc[i] = df['velocity'][j+1:i+1].mean()

更新:由于这个答案,OP表示他们想要一个“有效的Pandas解决方案(例如没有循环)”。如果我们认为这意味着他们想要比上述更高效的东西,那么,或许讽刺地给出评论,首先想到的优化是避免数据框架,除非需要:

l = len(df)
a = np.empty(l)
d = df['distance'].values
v = df['velocity'].values
for i in range(l):
    j = i
    s = 0
    while j >= 0 and s < 5:
        s += d[j]
        j -= 1
    if s >= 5:
        a[i] = v[j+1:i+1].mean()
df['rv'] = a

此外,正如@JohnE所建议的那样,numba很快就会进一步优化。虽然它对上面的第一个解决方案没有太大作用,但第二个解决方案可以使用@numba.jit开箱即用的装饰,并立即带来好处。

对所有三种解决方案进行基准测试
pd.DataFrame({'velocity': 50*np.random.random(10000), 'distance': 5*np.random.rand(10000)})

我得到以下结果:

          Method                 Benchmark
-----------------------------------------------
Original data frame based     4.65 s ± 325 ms
Pure numpy array based       80.8 ms ± 9.95 ms
Jitted numpy array based      766 µs ± 52 µs

即使看起来无辜的mean也足以甩掉numba;如果我们摆脱这种情况而转而使用

@numba.jit
def numba_example():
    l = len(df)
    a = np.empty(l)
    d = df['distance'].values
    v = df['velocity'].values
    for i in range(l):
        j = i
        s = 0
        while j >= 0 and s < 5:
            s += d[j]
            j -= 1
        if s >= 5:
            for k in range(j+1, i+1):
                a[i] += v[k]
            a[i] /= (i-j)
    df['rv'] = a

然后基准降低到158μs±8.41μs。

现在,如果您碰巧了解df['distance']的结构,while循环可能会进一步优化。 (例如,如果值总是远低于5,那么从尾部剪切累积总和会更快,而不是重新计算所有内容。)