嗨我是python的新手,我试图创建我的第一个程序来查找具有+1符号的节点集群。我有一个包含3列的文件(起始节点,结束节点,节点之间的符号),如下所示:
1 2 1
1 3 1
2 3 1
2 4 -1
2 5 1
3 6 -1
4 7 -1
4 9 -1
我创建图表并保存字典中的所有邻接。现在我想在另一个字典(defaultdict(list))中保存所有超节点(团队节点之间有+1符号)。所以我写了下面的代码:
G = nx.Graph()
G = nx.read_edgelist('example.txt', delimiter='\t', nodetype=int, data=(('sign', int),))
adjacencies = {}
supernodes = defaultdict(list)
for i in G.nodes:
adjacencies[i] = list(G.neighbors(i))
flag = 0
if flag == 0:
for node in G.nodes:
supernodes[node].append(node)
flag = 1
break
else:
for i in G.nodes():
for j in adjacencies[i]:
if G.get_edge_data(i,j) == 1:
for v in supernodes.values():
我在这里停止代码,因为我不知道如何将元素放到dict的正确位置。我想要做的步骤是: 我有超级节点,如:
1 : [1,2,3,5]
2 : [4]
3 : [6,8]
等
1. check if edge(i,j) is +1 and then
2. if i is in supernodes then add j in the same list where i is
3. if j is in supernodes then add i in the same list where j is
4. if i and j is not in supernodes the add a new list in supernodes and add
i,j elements
答案 0 :(得分:1)
您要使用collections.defaultdict
的任何特殊原因?
无论您使用deafaultdict
还是常规dict
,都可以使用以下代码查找超级节点。方法setdefault
适用于两者。查看setdefault
here的内容。
G = nx.read_edgelist('example.txt', delimiter='\t', nodetype=int, data=(('sign', int),))
supernodes = dict()
for edge in G.edges(data='sign'):
sign = edge[2]
if sign == 1:
node1 = edge[0]
node2 = edge[1]
supernodes.setdefault(node1, [node1])
supernodes.setdefault(node2, [node2])
supernodes[node1].append(node2)
supernodes[node2].append(node1)
[编辑]查看图表的图形并了解OP想要的内容,这是一种方法:
import networkx as nx
G = nx.read_edgelist('example.txt', delimiter='\t', nodetype=int, data=(('sign', int),))
G1 = nx.Graph()
G1.add_weighted_edges_from([edge for edge in G.edges(data='sign') if edge[2]==1])
G1.add_nodes_from(list(G.nodes))
supernodes = list(nx.connected_components(G1))
supernodes
是一个集合列表,其中每组节点都是图片中的一个 blob 。