Welch t检验,在R中基于置换的FDR调整p值

时间:2017-11-20 15:22:04

标签: r t-test fdr q-value

我需要一些帮助来找到一种方法来计算R中Welch p值的q值,使用置换FDR方法,与SAM技术一样。

假设我的数据如下

x = matrix(rnorm(1000*3),nrow=1000)
y = matrix(rnorm(1000*3),nrow=1000)

我可以获得每个'行x-vs-y'的Welch p值列表,如下所示

pvalues = sapply(1:1000, function(n) t.test(x[n,], y[n,])$p.val)

如何使用置换fdr调整p值? 据我所知,p.adjust不能这样做,samr只允许t统计或wilcoxon,我找不到任何可以帮助我的包。 有什么建议吗?

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