Question

我的项目具有以下目录结构：

.
├── Makefile
├── pxd
├── pyx
│   ├── Landscaping.pyx
│   ├── Shrubbing.pxd
│   └── Shrubbing.pyx
└── setup.py

但是，如果我将Shrubbing.pxd移到pxd/的任何其他地方，我会收到以下错误：

Error compiling Cython file:
------------------------------------------------------------
...
import pyx.Shrubbing
cimport Shrubbing
       ^
------------------------------------------------------------

pyx/Landscaping.pyx:2:8: 'Shrubbing.pxd' not found

Error compiling Cython file:
------------------------------------------------------------
...
import pyx.Shrubbing
cimport Shrubbing

cdef Shrubbing.Shrubbery sh
    ^
------------------------------------------------------------

这很奇怪，因为setup.py我有：

from distutils.core import setup, Extension
from Cython.Build import cythonize
setup(ext_modules=cythonize([
    Extension(
        'pyx.Landscaping',
        sources=["pyx/Landscaping.pyx"],
        include_dirs=['pxd']), # <-- HERE
    Extension('pyx.Shrubbing', sources=["pyx/Shrubbing.pyx"])
]))

清楚地指定Shrubbing.pxd的新目录。

源文件都很短，但为了避免使这篇文章变得混乱，我只想发布一个链接到存储库：https://github.com/lobachevzky/landscaping

感谢您的帮助。

Answer 1

include_dirs用于C / C ++标头，而不是Cython pxd文件。

一般情况下，最好将相关的pyx/pxd文件保存在同一目录中，即Shrubbing.pyx和Shrubbing.pxd应位于同一目录中。

然后使用其他模块中的内容，通过扩展名中使用的名称包含__init__.pxd和cimport，例如pyx.Shrubbing，就像使用Python一样模块。

如果在python中导入（不是cimport），也应该包含__init__.py。

在同一模块OTOH中使用时，.pxd需要在该模块的运行时可用，这意味着将其包含在 Python 搜索路径中。

如果要将pxd文件组织到单独的目录中，请在模块目录中以符号方式链接它们，以使它们可供模块使用，dir包含__init__.pxd或.py文件。

由于Cython目前不支持相对导入，因此需要在从另一个目录导入时需要链接。

请参阅documentation for more details。

Answer 2

严格地说，这个答案比你提出的具体问题更广泛。它更“如何在包之间共享pxd定义”。

为了自己解决这个问题，我创建了一个cython_example回购。这并不令人满意，因为它使用旧的distutils工具而不是setuptools来阻止zip/egg封装底层文件，但可能会在这里阐明一些内容。我正在积极寻找可以自动从egg文件中提取代码的改进，以便setuptools可以使用。

核心思想是使用os.path.dirname(from_package.__file__)来添加到包含路径。请参阅setup.py文件。

<强>更新：

cython email list提供了一个提示，即使用zip_unsafe进行安装时使用setuptools会使一切正常。请参阅updated working example和update I added至documentation。

如何在Cython中指定`.pxd`文件的路径

2 个答案: