错误无法使用prcomp将常量/零列重新调整为单位方差

Question

我有一个包含290个观察数据和24475个特征的数据集， 我将数据集拆分为使用以下代码训练数据集和测试数据集：

set.seed（107）  y＆lt; -dim（data）[2] -1  需要（尖）  inTrain＆lt; - createDataPartition（y = data [，y]，p = precent_of_partition，list = FALSE）  培训＆lt; - 数据[inTrain，]  测试＆lt; - data [-inTrain，]

当我尝试在火车上执行pca时：  pca.result＆lt; - prcomp（expression_matrix，center = TRUE，scale。= TRUE）

我收到此错误：

prcomp.default出错（expression_matrix，center = TRUE，scale。= TRUE）：  不能将常数/零列重新调整为单位方差

但如果我在所有数据集上执行pca，我根本就不会得到错误并且它可以正常工作，

有人可以澄清什么是hepping？我该如何解决这个问题？

Answer 1

使用R stdio读取数据后，可以使用： data1 <-data [，apply（data，2，function（x）all（x> 0））] pca.result <-prcomp（data1，center = TRUE，scale。= TRUE） 该功能正在删除数据集中的零。