ReformAlign可执行文件不稳定。

Question

我已经从makefile编译和执行（ReformAlign），但是，在启动它时，它会立即打开和关闭。

是否有一些我没有做或应该做的事情来使工作正常。 非常感谢任何建议和帮助。

Answer 1

  

启动它时，会立即打开和关闭

你没有提供太多背景信息。我怀疑启动它，你的意思是点击Windows中的一个图标。该程序运行，因为它非常小，立即完成。它运行的窗口几乎没有显示在屏幕上，如果有的话。

如果是这种情况，请启动 cmd.exe ，然后从命令行运行程序。这将使您有机会看到它的输出。

Answer 2

也许您应该尝试从命令窗口运行可执行文件。

在Windows上：启动 cmd.exe ，然后在cmd中转到保存ReformAlign.exe文件的目录。您可以使用cd命令更改目录 之后，您只需键入可执行文件的名称即可开始运行。

例：
C:\Users\Nabi> cd YourFileDirectory\MaybeSomeSubdirectory
按Enter键，然后键入* .exe文件的名称 C:\Users\Nabi\YourFileDirectory\MaybeSomeSubdirectory> ReformAlign.exe
再次按Enter，您的文件应该开始。

Answer 3

ReformAlign没有对齐器，但改革先前对齐序列（来自目标对齐器）。只需输入; ReformAlign.exe i- Sequences.fasta -o Output.fasta -a Init_align.fasta 是Sequences.fasta是你的未对齐序列，output.fasta = RefromAlign输出和Init_Align.fasta你以前或最初对齐的序列。最初的alignes序列应该是有条件的，否则ReformAlign可能会返回与未对齐序列没有区别的输出。