Question

我想在R markdown pdf报告中包含错误消息。这很有效：

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output: pdf_document
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This will be knitted and show the error message in the pdf.
```{r, error = TRUE}
stopifnot(2 == 3)
```

但是，如果我尝试使用来自testthat的错误的相同方法，我的文档就不再编织了。

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output: pdf_document
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This will not knit
```{r, error = TRUE}
library(testthat)
expect_equal(2, 3)
```

为什么？我该怎么做才能包含来自testthat expect_something函数的错误消息，而不会将它们包含在测试中？

我认为这一定是可能的，因为Hadley Wickham在其直接来自expect_something - 函数的R包中包含了许多错误消息。

这是相关的，但未在Include errors in R markdown package vignette和How to skip error checking at Rmarkdown compiling?

中得到解答

Answer 1

我不明白行为的原因（好问题！），但这可能是一种解决方法：

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output: pdf_document
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This will knit
```{r, error = TRUE}
library(testthat)
# expect_equal(2, 3)
# skip_if_not(2, 3)
assertthat::assert_that(2 == 3)
```

Answer 2

创建测试：

```{r, error = TRUE}
library(testthat)
test_that("Test A", {
  expect_equal(2, 3)
})
```

在R markdown文档中包含来自testthat的错误消息

2 个答案: