我想通过索引对ffdf对象进行子集化,返回另一个ffdf对象。
help file on subset.ffdf表示您可以传递范围索引(ri)对象作为参数,但是当我尝试时:
data_subset <- subset.ffdf(data, ri(1, 1e5))
我收到了这个错误:
Error in which(eval(e, nl, envir)) : argument to 'which' is not logical
Per You-Leee的建议,我尝试使用以下代码传递感兴趣的索引的逻辑向量:
n <- length(data[[1]]) #10.5 million
logical_index = c(1, 1e5) == seq.int(1, n)
data_subset <- subset(data, logical_index)
我尝试运行它两次,每次我的R-Studio崩溃时都会显示消息R encountered a fatal error. The session was terminated.
起初我认为这可能是一个内存限制,但是看着我的活动监视器,我仍然有4gb可用8GB。此外,无论如何,这不应该加载到内存中。
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参数必须是合乎逻辑的,所以你必须在期望的索引上设置为TRUE,否则为FALSE:
> data <- ffdf(a = ff(1:12))
> subset.ffdf(data, c(1, 1e5) == seq.int(1, length(data$a)))
ffdf (all open) dim=c(1,1), dimorder=c(1,2) row.names=NULL
ffdf virtual mapping
PhysicalName VirtualVmode PhysicalVmode AsIs VirtualIsMatrix PhysicalIsMatrix
a a integer integer FALSE FALSE FALSE
PhysicalElementNo PhysicalFirstCol PhysicalLastCol PhysicalIsOpen
a 1 1 1 TRUE
ffdf data
a
1 1