Question

我在尝试创建固定效果（模型1）双向ANOVA数据的交互图时遇到编码问题。我输入并将我的数据从excel导入RStudio。数据如下。

Sex Genotype    Activity
Female  I   2.838
Female  I   4.216
Female  I   2.889
Female  I   4.198
Female  II  3.55
Female  II  4.556
Female  II  3.087
Female  II  1.943
Female  III 3.62
Female  III 3.079
Female  III 3.586
Female  III 1.943
Male    I   1.884
Male    I   2.283
Male    I   2.939
Male    I   1.486
Male    II  2.396
Male    II  2.956
Male    II  3.105
Male    II  2.649
Male    III 2.801
Male    III 3.421
Male    III 2.275
Male    III 2.11

然后我将其保存为Excel工作簿。然后我在RStudio中找到文件＆gt;导入数据集＆gt; Excel＆gt;选择我的数据集文件＆gt;选择第一行作为名称＆amp;打开数据查看器。我检查了我的数据，它全部在三列的三个标题下。然后做我的ANOVA我做了：

Model_1 <- aov(Activity ~ Sex*Genotype, data=data7)
> summary(Model_1)
         Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)  
Sex           1  3.527   3.527   6.563 0.0196 *
Genotype      2  0.178   0.089   0.165 0.8488  
Sex:Genotype  2  1.166   0.583   1.085 0.3591  
Residuals    18  9.673   0.537

接下来，我尝试制作一个互动情节：

interaction.plot(Genotype,Sex,Activity, fun = mean, type= c("b"), xlab= 
"Genotype" ,ylab = "Enzyme Activity (enzyme unit (U)=1µmol min-
1)",main="Interaction Plot" )

但是，当我这样做时，我收到了这个错误：

 Error in tapply(response, list(x.factor, trace.factor), fun) : object 'Genotype' not found

如何将基因型和性别作为对象？他们不应该已经成为ANOVA表中显示的对象吗？

另外，我想为每个单元格制作一个Mean，SD和n的表，但是当我尝试使用单因素方差分析时，它不适用于双向。你怎么做这样的桌子？

我在网上尝试了以下示例，但是没有一个能帮助我创建交互图，我还没有看到任何关于如何制作表格的好例子（即使在这个网站上）， SD和n用于双向ANOVA，适用于我的情况。我有什么方法可以用来帮助我吗？

如果有人能帮助解释我做错了什么以及如何制作表格，我会非常感激。

Answer 1

两种方法。使用基本功能

#nj is your dataframe which I loaded using
nj <-read.table("nj_data.txt", header = T)
#Base R - using built-in functions
# the Dot indicates variable(column) to work on
# if you have more than one variable use their names
#good practice to use na.rm = T, to make sure you exclude
# NA - missing values, other wise mean and sd will report NA
aggregate(. ~ Sex+Genotype, data = nj,
          FUN = function(x) c(Mean = mean(x, na.rm = T),
                              n = length(x),
                              sd = sd(x, na.rm = T)))

#using dplyr - I suggest this as syntax is nicer
library(dplyr)
nj %>% group_by(Sex, Genotype) %>%
summarise_all(funs(mean(., na.rm = T),sd(., na.rm = T),n()))
#here the "." in mean and sd means using the data given 
#equivalent to x in base R above

读取Tidyverse（一组新的库，使数据分析更容易）在https://www.tidyverse.org/

以及ggplot - 这是使用ggplot进行交互图的一个很好的入门 https://sebastiansauer.github.io/vis_interaction_effects/

Answer 2

这是最基本的解决方案，也许很有效但是很有效：

data7$group=paste(data7$Sex,data7$Genotype,sep="_")

tapply(data7$Activity,data7$group,sd)

R：如何为双因素方差分析创建交互图

2 个答案: