我有两个感兴趣的矩阵,第一个是"字袋"矩阵,有两列:文档ID和术语ID。例如:
bow[0:10]
Out[1]:
array([[ 0, 10],
[ 0, 12],
[ 0, 19],
[ 0, 20],
[ 1, 9],
[ 1, 24],
[ 2, 33],
[ 2, 34],
[ 2, 35],
[ 3, 2]])
另外,我有一个"索引"矩阵,其中矩阵中的每一行都包含单词矩阵包中给定文档ID的第一行和最后一行的索引。例如:第0行是doc id 0的第一个和最后一个索引。例如:
index[0:4]
Out[2]:
array([[ 0, 4],
[ 4, 6],
[ 6, 9],
[ 9, 10]])
我想要做的是随机抽取文档ID并获取这些文档ID的所有单词行。单词矩阵包大约150M行(~1.5Gb),因此使用numpy.in1d()太慢了。我们需要快速返回这些信息,以便为下游任务提供支持。
我提出的天真解决方案如下:
def get_rows(ids):
indices = np.concatenate([np.arange(x1, x2) for x1,x2 in index[ids]])
return bow[indices]
get_rows([4,10,3,5])
通用样本
提出问题的一般样本将是这样的 -
indices = np.array([[ 4, 7],
[10,16],
[11,18]]
预期的输出是 -
array([ 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17])
答案 0 :(得分:4)
认为我最终使用cumsum
技巧解决了它的矢量化解决方案 -
def create_ranges(a):
l = a[:,1] - a[:,0]
clens = l.cumsum()
ids = np.ones(clens[-1],dtype=int)
ids[0] = a[0,0]
ids[clens[:-1]] = a[1:,0] - a[:-1,1]+1
out = ids.cumsum()
return out
样品运行 -
In [416]: a = np.array([[4,7],[10,16],[11,18]])
In [417]: create_ranges(a)
Out[417]: array([ 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17])
In [425]: a = np.array([[-2,4],[-5,2],[11,12]])
In [426]: create_ranges(a)
Out[426]: array([-2, -1, 0, 1, 2, 3, -5, -4, -3, -2, -1, 0, 1, 11])