Rcpp没有找到Boost标头

时间:2017-11-01 21:36:23

标签: c++ r boost rcpp

我在R软件包项目中有一个名为src/windows.cpp的文件(向量的窗口函数,与MS Windows无关!)。文件顶部如下所示:

// [[Rcpp::depends(BH)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

#include <Rcpp.h>
#include <algorithm>
#include <boost/algorithm/string/join.hpp>

using namespace Rcpp;

这似乎不足以让它找到Boost标头 - 当我执行devtools::load_all(.)来触发编译时,我看到这个构建失败:

* installing *source* package ‘MyPackage’ ...
** libs
g++ -m64  -I/usr/include/R -DNDEBUG  -I"/home/rstudio/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" 
-I/usr/local/include  -std=c++11 -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2
-fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m64 -mtune=generic  -c windows.cpp -o windows.o
windows.cpp:6:43: fatal error: boost/algorithm/string/join.hpp: No such file or directory
 #include <boost/algorithm/string/join.hpp>
                                           ^
compilation terminated.

我已安装BH,并且存在相关标头:

> .libPaths()[1]
[1] "/home/rstudio/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4"

> dir(file.path(.libPaths()[1], 'BH/include/boost/algorithm/string'))
 [1] "case_conv.hpp"             "classification.hpp"        "compare.hpp"              
 [4] "concept.hpp"               "config.hpp"                "constants.hpp"            
 [7] "detail"                    "erase.hpp"                 "find_format.hpp"          
[10] "find_iterator.hpp"         "find.hpp"                  "finder.hpp"               
[13] "formatter.hpp"             "iter_find.hpp"             "join.hpp"                 
[16] "predicate_facade.hpp"      "predicate.hpp"             "regex_find_format.hpp"    
[19] "regex.hpp"                 "replace.hpp"               "sequence_traits.hpp"      
[22] "split.hpp"                 "std"                       "std_containers_traits.hpp"
[25] "trim_all.hpp"              "trim.hpp"                  "yes_no_type.hpp"   

看起来核心问题是[[Rcpp::depends(BH)]]指令没有将相关的Boost目录添加到编译器指令中,对吧?在我的设置中我应该寻找什么可能导致这种情况?

我已将BH添加到Imports:文件的DESCRIPTION部分,这是正确/可取的吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

是否按照here的说法将其添加到LinkingTo

Further

  

请注意,Rcpp::depends属性会建立依赖关系   对于sourceCpp,重要的是要注意如果包含相同的内容   R包中的源文件仍然必须列在这些依赖项中   包Imports文件的LinkingTo和/或DESCRIPTION字段。   ...   只提供C ++头文件(没有共享库)的软件包只需要使用LinkingTo来引用。