Question

我是R的初学者，不熟悉语法。非常感谢您的帮助。

我有一个包含3列和27行的数据框。

<script>
    $(document).ready(function(){
        $.ajaxSetup({headers: {"X-CSRFToken": getCookie("csrftoken")}});
    });

    function getCookie(name) {
        function escape(s) { return s.replace(/([.*+?\^${}()|\[\]\/\\])/g, '\\$1'); };
        var match = document.cookie.match(RegExp('(?:^|;\\s*)' + escape(name) + '=([^;]*)'));
        return match ? match[1] : null;
    }
</script>

我想制作Grouped Barplot，我在X轴上有基因名称，在Y上有不同颜色的cell_line1和Cell_line2值。

我试图用ggplot2

制作它

Gene_Name Cell_line1 Cell_line2
gene1        23          45
gene2        0.6         21
gene3        34          18
---
gene27       45          23

你能纠正我的代码吗？还是建议别的什么？

感谢。

Answer 1

以下是示例数据，因为您没有提供太多工作：

df <- data.frame(Gene_Names = LETTERS, 
                 Cell_line1 = 10, 
                 Cell_line2 = 8)

以下是重塑数据的方式：

df <- df %>% tidyr::gather("Cell_line", "Value", 2:3)

您描述的情节示例：

ggplot(data=df, aes(x = Gene_Names, y = Value, fill = Cell_line)) + 
  geom_bar(stat="identity", position = "dodge", width = .5)+ 
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1))

数据框R的条形图

1 个答案: