将gsub命令从R转换为Python

Question

我想拆分这个mystring =＆＃34; 0G15 ^ GAC0T60T4 ^ AA0C0＆＃34;并使用python获取以下输出：

['0','G','15','^GAC','T','60','T','4','^AA','C']

可以在R：

中使用此命令完成

mystring <- "0G15^GAC0T60T4^AA0C0"
gsub("([\\^]*[ACGT]+)[0]*", " \\1 ", mystring)

如何将R脚本翻译成python？

由于

Answer 1

您可以使用Pythons re module

重用现有的正则表达式

import re

mystring = "0G15^GAC0T60T4^AA0C0"
l = re.sub("([\\^]*[ACGT]+)[0]*", " \\1 ", mystring).split()

然后

l

['0', 'G', '15', '^GAC', 'T', '60', 'T', '4', '^AA', 'C']

Answer 2

你可以试试这个：

mystring="0G15^GAC0T60T4^AA0C0" 
import re
new_data = re.findall('(?<!\^[GAC])\d+|(?<!\^)\w|\^[a-zA-Z]+', mystring)
final_data = [a for i, a in enumerate(new_data) if a != '0' or not new_data[i-1].startswith("^")][:-1]

输出：

['0', 'G', '15', '^GAC', 'T', '60', 'T', '4', '^AA', 'C']