应用于stan对象的extract（）和as.matrix（）之间的差异

Question

我有一个Stan模型（称为fit），我得到了一些奇怪的结果。我知道我可能遗漏了一些东西，但我无法看到哪里和那些东西。在这种情况下，我想查看参数sigma_h。

如果我使用as.matrix从fit获取样本，我会得到以下结果：

posterior <- as.matrix(fit) 
trace_sigma_h <- posterior[,colnames(posterior) %in% "sigma_h"]
ts.plot(trace_sigma_h)

这与我使用rstan::traceplot函数时获得的情节相同。

如果我从fit对象中提取样本并绘制它，我会得到

samples <- extract(fit,inc_warmup = FALSE)
ts.plot(samples$sigma_h) 

这些情节不一样。我错过了什么？仅仅将fit对象设为矩阵并提取样本之间是否存在差异？