Question

我正在尝试加载MRI，我不断收到以下错误：

Traceback (most recent call last): 
File "F:/Study/Projects/BTSaG/Programs/t3.py", line 2, in <module> epi_img = nib.load('someones_epi.nii.gzip') 
File "C:\Users\AnkitaShinde\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\site-packages\nibabel\loadsave.py", line 38, in load raise FileNotFoundError("No such file: '%s'" % filename) 
FileNotFoundError: No such file: 'someones_epi.nii.gzip'

使用的代码如下：

import nibabel as nib
epi_img = nib.load('someones_epi.nii.gzip')
epi_img_data = epi_img.get_data()
epi_img_data.shape(53, 61, 33)
import matplotlib.pyplot as plt
def show_slices(slices):
""" Function to display row of image slices """
fig, axes = plt.subplots(1, len(slices))
for i, slice in enumerate(slices):
     axes[i].imshow(slice.T, cmap="gray", origin="lower")
slice_0 = epi_img_data[26, :, :]
slice_1 = epi_img_data[:, 30, :]
slice_2 = epi_img_data[:, :, 16]
show_slices([slice_0, slice_1, slice_2])
plt.suptitle("Center slices for EPI image")

我还更新了nibabel中的loadsave.py文件，但它没有用。请帮忙。

编辑： 之前的错误已得到解决。现在又遇到了另一个错误。

Traceback (most recent call last):File "F:\Study\Projects\BTSaG\Programs\t3.py", line 2, in <module> epi_img = nib.load('someones_epi.nii.gzip')
File "C:\Users\AnkitaShinde\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\lib\site-packages\nibabel\loadsave.py", line 47, in load filename)
nibabel.filebasedimages.ImageFileError: Cannot work out file type of "someones_epi.nii.gzip"

Answer 1

这是一个古老的问题，但是我可能有解决方案。

我刚刚发现nibabel.save（）不允许我在文件夹名称中使用点.或破折号-。这些可以存在于文件名中。就您而言，当前路径为：

C:\Users\AnkitaShinde\AppData\Local\Programs\Python\Python35-32\Lib\site-packages\nibabel\someones_epi.nii.gzip

我将其更改为：

C:\Users\AnkitaShinde\AppData\Local\Programs\Python\Python35_32\Lib\site_packages\nibabel\someones_epi.nii.gzip

这仅是示例。当然，我并不是说您实际上要更改这些软件包文件夹的名称，因为这可能会导致其他错误。

实际的解决方法是将文件someones_epi.nii.gzip移至用户结构，例如：

C:\Users\AnkitaShinde\Desktop\nibabel\someones_epi.nii.gzip

FileNotFoundError：没有这样的文件：＆＃39; someones_epi.nii.gzip＆＃39;

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