Question

我有一个文件（sample.bedgraph），其行如下：

8   43825627    43825628    1313
X   1753769 1753780 14

我想摆脱任何字段4小于10且大于150的行 - 过滤后的文件应该只有第二行。我知道我可以做到：

awk '$4 >= 10 && $4 <= 150' sample.bedgraph > sample.filtered.bedgraph

然而，我的10和150阈值来自某些上游管道命令，我需要将它们称为$ Min和$ Max，所以如果我这样做：

awk '$4 >= $Min && $4 <= $Max' sample.bedgraph > sample.filtered.bedgraph

根本没有回报。如果我添加＆＃34;＆＃39;＆＃34;我的变量（$ Min和$ Max），它不会过滤掉任何一条线。如果我只与最小值或最大值进行比较，则不起作用。我查了一些其他帖子，人们建议＆＃34; -v＆＃34;，但我也没有运气。

任何建议表示赞赏。谢谢。

Answer 1

假设你有像

这样的shell变量

$ Min=10
$ Max=150

在awk中你可以使用如下所示，如果记录/行/行中的第4个字段位于10到150之间，则会打印这样的记录。

$ awk -v min="$Min" -v max="$Max" '$4 >= min && $4 <= max' sample.bedgraph > sample.filtered.bedgraph

我想摆脱任何字段4小于10的行大于150 - 过滤后的文件应该只有第二行。一世我知道我可以做到：

使用AND不能同时使用小于10且大于150的字段4，因此您可以使用下面的OR：

awk '$4 < 10 || $4 >150 {next}1' infile

测试结果：

$ cat infile
8   43825627    43825628    1313
X   1753769 1753780 14

$ awk '$4 < 10 || $4 >150 {next}1' infile
X   1753769 1753780 14

Answer 2

几乎是@3161993所说的，但你可以使用双引号（"）作为awk，让shell展开$Var。它正在寻找麻烦（许多逃避），但在这里：

$ awk "\$4 >= $Min && \$4 <= $Max" file
X   1753769 1753780 14