Question

这个问题可能非常幼稚但是在Julia循环（使用RCall模块）而不是R循环内调用R函数在性能方面是否有优势（因为R循环很慢）？当然，来自朱莉娅的众多R Call看起来效率不高但有人测试过它吗？

我希望有些专家可以指出这种方法的限制和优点。谢谢。

Answer 1

tl; dr 这取决于但可能不是。

基本上＆＃34;它取决于＆＃34;。但是，如果你在循环中所做的只是调用一段R代码，那么可能不会...即开销将比仅用一种语言完成所有工作更大。如果您可以在想要使用的底层R包中找到C绑定（它们可能存在也可能不存在），那么使用ccall可能是值得的。

非常粗略的基准测试（少量盐，额外运行编译未显示）。

f1(N) = begin
   R"x=0"
   for i in 1:N
       R"x = x + $i*1.4"
   end
   x = rcopy(R"x")
end


f2(N) = begin rcopy(R"""
   x = 0
   for (i in 1:$N) {
       x = x + i*1.4
   }
   x
   """)
 end

julia> @time f1(10000)
  0.706926 seconds (919.54 k allocations: 26.697 MiB, 1.80% gc time)
7.0007e7

julia> @time f2(10000)
  0.010227 seconds (129 allocations: 4.281 KiB)
7.0007e7

在julia循环中调用R函数是否值得？

1 个答案: