Question

我的最终目标是让python包graph_tool在我的系统上工作，如果可能的话也在ipynb上工作。我已经brew install graph-tool，as indicated here，但这还不够。

所以我跟着Anaconda instructions here，我取得了不错的进展，直到无法找到CGAL图书馆。

注意：为了遵守Anaconda说明，我安装了anaconda3并创建了一个新的conda环境（名为py36env）来conda安装所有必需的软件包（必须与python 3.6匹配的软件包）

(py36env) $ ./configure --prefix=/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env/ --with-python-module-path=/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env/lib/python3.6/site-packages --with-cgal=/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env/
.
.
checking whether CGAL is available in /Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env/... no
configure: error: CGAL library not found.

entire config.log。以下是一个片段：

configure:21200: checking whether CGAL is available in /Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env/
configure:21236: g++ -std=gnu++14 -o conftest -fopenmp -O3 -fvisibility=default -fvisibility-inlines-hidden -Wno-deprecated -Wall -Wextra -ftemplate-backtrace-limit=0  -DNDEBUG  -I/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env//include -pthread -I/usr/local/include  -L/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env//lib -lCGAL -lCGAL_Core -lgmp -lboost_thread-mt -lpthread conftest.cpp -lgmp -lgmp  >&5
|       #include <CGAL/Exact_predicates_inexact_constructions_kernel.h>
|       #include <CGAL/convex_hull_2.h>
|       typedef CGAL::Exact_predicates_inexact_constructions_kernel K;
|       CGAL::convex_hull_2(points.begin(),points.end(),std::back_inserter(result));
configure:21278: error: CGAL library not found.
CGAL_CPPFLAGS='-I/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env//include'
CGAL_FLAGS=''
CGAL_LDFLAGS='-L/Users/tamtran/anaconda3/envs/py36env//lib -lCGAL -lCGAL_Core -lgmp -lboost_thread-mt -lpthread'

注意：即使没有--with-cgal标记，也会出现同样的问题。同样重要的（我认为）CGAL搜索目录在py36env内，因为CGAL与python3.6匹配在那里，而CGAL-python3.5在conda根环境中。没有CGAL目录的./configure输出的唯一区别是：

checking whether CGAL is available in /usr... no
checking whether CGAL is available in /usr/local... no
checking whether CGAL is available in /opt... no
checking whether CGAL is available in /opt/local... no

Answer 1

在mac os x上你必须使用-lcgal（正在使用brew）

例如在fedora linux -lCGAL

上

configure：error：找不到CGAL库

1 个答案: