我想在R中的heatmap.2函数的代码中调整trace参数（热图中可见的线分割），以最终删除虚线，但保留实线。更一般地，我还想学习如何调整用户定义的函数。
我在这里找到了关于如何执行此操作的建议：https://support.bioconductor.org/p/42819/。
但是，当我调整代码中的任何内容时（例如，trace参数的行类型）（使用函数fix（）或使用其他名称创建一个新函数，但使用相同的代码），我开始得到错误在R中找不到某些函数，例如invalid（）和plot.dendrogram（）。我为这些功能安装了单独的软件包，但这并没有解决问题。更糟糕的是，当使用fix（）方法时，即使我撤消了代码更改，hotmap.2也会从这一点继续获取这些错误，并且我必须重新安装gplots包。
我不明白heatmap.2函数如何运行它们没有问题，但是当我调整代码时，找不到这些底层函数。
TLDR：如何在R中安全地调整功能，特别是heatmap.2功能？
任何帮助都将不胜感激。
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通常情况下，您应该只需运行print x.text
即可获得所有代码而无需任何选项（很多选项），然后将其复制并按照生物传感器中的建议分配给新功能。这是普遍接受的方式。我不认为这里需要heatmap.2方法，因为它确实会覆盖工作区中的对象（即除非您清除工作区，否则更改的fix()将优先）。
为方便起见，我创建了一个包含普通代码的要点，并将其分配给一个新函数。我会将其粘贴到您工作目录中的新文件（例如heatmap3.R）和当前分析脚本中的heatmap.2。当然你可能需要编辑这个文件，我已经注释掉了345-348和359-362行，我认为这些行是虚线。这应该是尝试调整现有功能时的一般策略（除非它们是S4 / S3或内部功能，然后东西变得更加棘手）
source("heatmap3.R")