Unix的。循环通过具有相同名称但不同染色体编号的Plink文件。产生输出

Question

我对Unix有基本的了解。我有一个22个具有此名称模式的文件列表：chr1_ASI，chr2_ASI，chr3_ASI ... chr22_ASI。

我想在OS X终端中使用此Plink命令循环遍历它们：

./plink --file /path/chr1_ASI --chr 1 --make-bed --out /path/chr1_ASI_filtered

然后对于2-22染色体也一样。

我想在Unix中使用for循环简化此脚本。这就是我所拥有的。

for i in {1..22}; do ./plink --file /path/chr${1}_ASI --chr ${i} --make-bed --out /path/chr${i}_ASI_filtered; done

但这不起作用。我可能正在做一些基本的错误。提前谢谢。

编辑：正如有人注意到的，我的错误就是写chr $ {1} _ASI而不是chr $ {i} _ASI。否则脚本运行得很好。

Answer 1

尝试将/path/chr${1}_ASI更改为/path/chr${i}_ASI