在R中,我如何从包中的导入类中继承对象?

时间:2017-10-20 14:47:38

标签: r oop devtools roxygen2

我正在研究R包并导入某个库。我正在创建一个从导入的库继承一个类的类。

在我的DESCRIPTIONS文件中,我有:

...
Imports:
    importedPackage

然后我有一个班级声明:

setClass("mySampleClass",
     slots = list(
       numUp = "numeric",
       numDown = "numeric"
     ),

     contains = "classToExtend"
)

如果我要导入importedPackage,我知道我需要将该包中的函数引用为importedPackage::someFunction()。虽然我的班级声明中有contains =部分,但我不能这样做。现在,它在构建时告诉我:

Error in reconcilePropertiesAndPrototype(name, slots, prototype, superClasses,  : 
   no definition was found for superclass “importedPackage::classToExtend” in the specification of class “mySampleClass”

我尝试了几种不同的方法来解决这个问题。这似乎是某人之前必须面对的那种问题,但到目前为止我无法找到谷歌如何正确地做到这一点。感谢您提前提供任何帮助。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我有同样的问题。如果你有继承关系的S4类,并且类在不同的.R文件中,则必须在子类(mySampleClass)之前加载包含超类(classToExtend)的文件。

这可以使用roxygen2包来完成,你可以在mySampleClass文件中记录

#' @include <file name containing classToExtend definition>  

这基本上意味着应用于该文件而不是下面的直接代码行。

因此,这基本上会在DESCRIPTION文件中创建一个collat​​e字段,并首先列出依赖项。

最后,为了让roxygen执行整理操作,您可能需要手动运行它。

roxygen2::update_collate(<package name>)

如果您想完全生成文档,请包含所有NAMESPACE更改,然后使用

devtools::document(<package name>)

这是一个问题,讨论包括整理顺序:How do I indicate collate order in Roxygen2?

这是roxygen2文档:http://roxygen.org/roxygen2-manual.pdf