Question

我从文件中提取数据，我想将这些工作（丑陋）命令行应用于给定文件夹中的所有txt文件。因此，我还需要在输出文件名后附加一个字符串，以避免在循环期间覆盖......欢迎任何建议。

for file in ./TEST/;
    do 
        awk '/R.Time/,/LC/' 070_WT3a.txt|awk '/R.Time/,/PDA/'|grep -v -E "PDA|LC"|grep -w -v "80,00000"|grep -w -v "80,00833"|grep -w -v "80,01667"|grep -w -v "80,01067"|grep -w -v "80,02133"|sed -n '1,9601p' > ./Output/Fluo.txt;
        awk '/R.Time/,/LC/' 070_WT3a.txt|awk '/R.Time/,/PDA/'|grep -v -E "PDA|LC"|grep -w -v "80,00000"|grep -w -v "80,00833"|grep -w -v "80,01667"|grep -w -v "80,01067"|grep -w -v "80,02133"|sed -n '9603,19203p' > ./Output/RID.txt;
    done

Answer 1

在循环内部，您可以使用变量${file}。第一个改进（可以在管道后添加额外的行）：

for file in ./TEST/;
do 
   filebasename=${file##*/}
   awk '/R.Time/,/LC/' ${file}.txt |
      awk '/R.Time/,/PDA/' |
      grep -v -E "PDA|LC" |
      grep -w -v "80,00000"|
      grep -w -v "80,00833"|
      grep -w -v "80,01667"|
      grep -w -v "80,01067"|
      grep -w -v "80,02133"|
      sed -n '1,9601p' > ./Output/Fluo_${filebasename};
   awk '/R.Time/,/LC/' 070_WT3a.txt |
      awk '/R.Time/,/PDA/'|
      grep -v -E "PDA|LC"|
      grep -w -v "80,00000"|
      grep -w -v "80,00833"|
      grep -w -v "80,01667"|
      grep -w -v "80,01067"|
      grep -w -v "80,02133"|
      sed -n '9603,19203p' > ./Output/RID_${filebasename};
done

接下来你可以做的就是改进解析如果没有示例输入/输出，很难看到/测试解决方案，我无法确定是否需要在9601/9603/19203行分割所有文件，这似乎适用于070_WT3a.txt。我想从跳过80*行开始，但这些行可能在里面有R.Time / LC的边界，所以这无济于事。您可能希望使用

在070_WT3a.txt上进行测试

awk '/R.Time/,/LC/' 070_WT3a.txt |awk '/R.Time/,/PDA/'|
   grep -v -E "PDA|LC"|grep -Ewv "80,0(0000|0833|1667|1067|2133)"

你可以尝试将2 awk组合成一个（或者甚至在grep内获得awk，但这会变得非常复杂，如果没有明确的话就难以测试要求和例子。

编辑：在使用示例输入进行测试后，我发现了这个简化：

for file in TEST/*.txt; do 
   filebasename=${file##*/}
   awk '/LC Chromatogram(Detector A-Ch1)/,/^80,/' "${file}" | 
      grep -E "^[0-7]" > Output/Fluo_${filebasename}
   awk '/LC Chromatogram(Detector B-Ch1)/,/^80,/' "${file}" |
      grep -E "^[0-7]" > Output/RID_${filebasename}
done

在循环内部我使用$ {file}，每个循环都有不同的文件名。 filenaam也用于输出文件的名称。文件名将以TEST/开头，可以使用${file##*/}进行删除（有很多不同的方法，例如使用cut -d"/"和sed 's/..，这个方法很快。）

如何自动保存并附加注释到文件名？

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