Question

sessionInfo（）

R版本3.4.1（2017-06-30）平台：x86_64-pc-linux-gnu（64位）   运行于：Ubuntu 16.04.3 LTS

Matrix产品：默认BLAS：   /home/roughmar/anaconda3/lib/R/lib/libRblas.so LAPACK：   /home/roughmar/anaconda3/lib/R/lib/libRlapack.so

区域设置：[1] LC_CTYPE = en_US.UTF-8 LC_NUMERIC = C
  [3] LC_TIME = en_IE.UTF-8 LC_COLLATE = en_US.UTF-8 [5]   LC_MONETARY = en_IE.UTF-8 LC_MESSAGES = en_US.UTF-8 [7]   LC_PAPER = en_IE.UTF-8 LC_NAME = C [9]   LC_ADDRESS = C LC_TELEPHONE = C [11]   LC_MEASUREMENT = en_IE.UTF-8 LC_IDENTIFICATION = C

附加基础包：[1] stats graphics grDevices utils
  数据集方法基础

通过命名空间加载（而不是附加）：[1] compiler_3.4.1   R6_2.2.1 magrittr_1.5 IRdisplay_0.4.4 [5] pbdZMQ_0.2-6
  tools_3.4.1 crayon_1.3.2 uuid_0.1-2 [9] stringi_1.1.5
  IRkernel_0.7.1 jsonlite_1.5 stringr_1.2.0 [13] digest_0.6.12
  repr_0.10 evaluate_0.10

每当我加载sqldf库时，我都会遇到：

加载必需的包：gsubfn

加载必需的包：proto

无法加载tcltk。将使用较慢的R代码。

加载必需的包：RSQLite

我编写的任何sqldf查询运行完美，结果如预期。当我在表达式上犯了错误，例如额外的逗号，或者误导变量，或者你可能想象的通常会输出错误的任何内容时，问题就会出现。

我没有收到错误 - 它只是崩溃了。在Rstudio和jupyter上都进行了测试 - 内核就死了，需要重新启动。经过一段时间后，它变得很累，因为我需要每次都重新加载所有变量。

我知道这很模糊，但我愿意提供可能需要的任何信息。

提前致谢！

Answer 1

我猜测这是在Anaconda，或者更普遍的是混合Conda和普通R.

在我的系统上---标准的Ubuntu（17.04）R（3.4.2）二进制文件通过CRAN镜像与标准sqldf ---一切正常：

R> a1r <- head(warpbreaks)     ## initial `help(sqdf)` example
R> a1s <- sqldf("select * from warpbreaks limit 6")
R> identical(a1r, a1s)
[1] TRUE
R> sqldf("selectFOO * from warpbreaks limit 6 BAR")   # no termination on error
Error in rsqlite_send_query(conn@ptr, statement) : 
  near "selectFOO": syntax error
R> 
R> sqldf("select * from warpbreaks limit 2")
  breaks wool tension
1     26    A       L
2     30    A       L
R>

当工具链断开时，二进制文件可能不兼容。

我建议在本地重建所涉及的软件包及其依赖项。因此，至少RSQLite和DBI，问题当然是这些包含了大量的其他软件包。

您也可以考虑在Docker中运行。

或者，像我（和其他人一样）做：不要让康达靠近你的R堆。

每当我不完美地编写sqldf查询时，R就会崩溃

1 个答案: