Fortran编译包含netcdf静态库的共享对象

Question

我正在尝试在fortran中创建一个使用netcdf静态库的共享对象。 最终的目标是在R中使用这个共享对象，但我认为问题始于我的makefile，所以我只关注这个：

在我的makefile中，我使用以下标志

'F90 = ifort
FFLAGS = -O3 -fPIC -r8 # double-precision now run in Fortran , -fpic 
for creating shared object file
LDFLAGS = -lnetcdff -lnetcdf -shared   #-shared, for creating a shared    
object file'

我想我设法将所有内容链接起来，（您在错误消息中看到下面的所有目标文件），但在下一步中，创建共享对象时，会出现netcdf-library特定的错误消息：

'ifort -O3 -fPIC -r8  -o HX.so HX.o HANDLE_ERR.o GET_CLM.o INTEGRATE.o 
CLIMATE.o STATE.o PARAMETERS.o CONTROL.o HYDRO.o DYNAMICS.o CARBON.o 
RINGS.o INIT.o SET_PARAMS.o -lnetcdff -lnetcdf -shared
ld: /usr/local/Cluster-Apps/netcdf/4.1.3/lib/libnetcdff.a(netcdf4.o): 
relocation R_X86_64_32 against `.bss' can not be used when making a 
shared object; recompile with -fPIC
/usr/local/Cluster-Apps/netcdf/4.1.3/lib/libnetcdff.a: could not read     
symbols: Bad value
make: *** [HX.so] Error 1'

我发现类似的＆＃39;问题，但由于我不熟悉术语，这是我第一次尝试生成共享对象，我无法按照他们的指示解决我的问题。

Answer 1

您需要安装NetCDF的动态​​（.so）版本，无论是从您的存储库还是自己编译它。正如tim18在评论中所说，它也需要用-fPIC编译，而.so版本将是。