无法在dockerfile中创建conda env

时间:2017-10-11 19:19:18

标签: python docker anaconda conda

我的应用程序文件夹中有environment.yml

我在dockerfile中有这个:

RUN conda env create
RUN source activate myenvfromymlfile

当我运行容器时,虽然没有激活env。如果我do conda env list,则/opt/conda被激活:

root@9c7181cf86aa:/app# conda env list
# conda environments:
#
myenvfromymlfile         /opt/conda/envs/myenvfromymlfile
root                  *  /opt/conda

如果我附加到容器,我可以手动运行source activate myenvfromymlfile并且它可以工作,但为什么不能在RUN指令中工作?

在示例中,我经常在需要conda的dockerfiles中看到这个:

CMD [ "source activate your-environment && exec python application.py" ]

有人可以解释为什么有必要使用&&使它成为一个命令?为什么在RUN指令中运行“source activate”不起作用?我希望我的dockerfile看起来像这样:

RUN conda env create
RUN source activate myenvfromymlfile
ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["application.py"]

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

考虑下面的Dockerfile

RUN conda env create
RUN source activate myenvfromymlfile
ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["application.py"]

声明#1 conda env create。创建环境并更改磁盘文件。

声明#2 source activate myenvfromymlfile。在bash会话中加载一些东西。这里没有完成磁盘更改

语句#3和#4指定运行容器时会发生什么

ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["application.py"]

所以现在当你运行容器时。您在步骤#2中执行的任何操作都不存在,因为启动了一个shell来执行步骤#2,当它完成时,shell已关闭。现在,当您运行映像时,将启动一个新的shell,它是全新的shell,现在知道您在dockerfile中已经运行了source activate myenvfromymlfile

现在您想在您创建的环境中运行此application.py。 docker的默认shell为sh -c。因此,当您将CMD设置为

CMD [ "source activate your-environment && exec python application.py" ]

在容器启动时执行的最终命令变为

sh -c "source activate your-environment && exec python application.py"

它会激活当前shell中的环境,然后运行您的程序。