Grep子目录并保存多个输出

时间:2017-10-11 17:14:47

标签: ubuntu unix grep

我有32个目录,每个目录都有一个.pdb文件。如何在这些文件上使用grep并将每个文件保存到特定输出?

预期输出类似于:

1.pdb > 1_clean.pdb
2.pdb > 2_clean.pdb
3.pdb > 3_clean.pdb
...
32.pdb > 32_clean.pdb

我尝试了以下但是没有用:

grep -r "^ATOM" *.pdb . > *_clean.pdb

1 个答案:

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查找 + shell 解决方案:

find -type f -name "[0-9].pdb" -exec sh -c 'fn=$1; n=${fn##*/}; n=${n%.*}; \
      grep "^ATOM" "$fn" > "${n}_clean.pdb"' _ {} \;