Question

我有一个名为list.txt的文件，它是一个文件名列表：

input1.txt
input2.txt
input3.txt

我想构建一个python脚本，为每个文件名创建一个文件。更确切地说，我需要它来打印一些文本，合并文件的名称并将其保存到一个唯一的.sh文件。我的脚本如下：

import os
os.chdir("/Users/user/Desktop/Folder")

with open('list2.txt','r') as f:    
    lines = f.read().split(' ')

for l in lines:
    print "#!/bin/bash\n#BSUB -J",l+".sh","\n#BSUB -o /scratch/DBC/user/"+l+".sh.out\n#BSUB -e /scratch/DBC/user/"+l+".sh.err\n#BSUB -n 1\n#BSUB -q normal\n#BSUB -P DBCDOBZAK\n#BSUB -W 168:00\n"
    print "cd /scratch/DBC/user\n"
    print 'grep "input"',l+" > result."+l+".txt"

    with open('script{}.sh'.format(l), 'w') as output:
        output.write(l)

我有几个问题：

输出文件只包含文件名 - 而不是我打印的内容。

要清楚我的输出文件（我应该有3个）应该如下所示：

#!/bin/bash
#BSUB -J input3.sh 
#BSUB -o /scratch/DBC/user/input1.sh.out
#BSUB -e /scratch/DBC/user/input3.sh.err
#BSUB -n 1
#BSUB -q normal
#BSUB -P DBCDOBZAK
#BSUB -W 168:00

cd /scratch/DBC/user
grep "input" input3 > result.input3.txt

我是Python的新手，所以我假设可以有更简单的方法来打印和插入我的文本。任何帮助将不胜感激。

更新我现在制作了以下脚本，它几乎可以工作。

import os
os.chdir("/Users/user/Desktop/Folder")

with open('list.txt','r') as f:
    lines = f.read().split('\n')

for l in lines:
    header = "#!/bin/bash \n#BSUB -J %s.sh \n#BSUB -o /scratch/DBC/user/%s.sh.out \n#BSUB -e /scratch/DBC/user/%s.sh.err \n#BSUB -n 1 \n#BSUB -q normal \n#BSUB -P DBCDOBZAK \n#BSUB -W 168:00\n"%(l,l,l)
    script = "cd /scratch/DBC/user\n"
    script2 = 'grep "input" %s > result.%s.txt\n'%(l,l)
    all= "\n".join([header,script,script2])

    with open('script_{}.sh'.format(l), 'w') as output:
        output.write(all)

我仍然遇到的问题是这会创建4个脚本，而不是我预期的3个脚本：script_input1.sh，script_input2.sh，script_input3.sh和script_sh。最后一个，script_sh只有印刷文本，但没有“输入”文本。我想这是因为我的list.txt文件末尾有一个“\ n”？但是，我看了，确实没有。有没有解决的办法？也许我可以使用某种长度函数？

Answer 1

所以，按顺序回答：

1）你能详细说明这个问题吗？如果您的代码只生成了3个不同的脚本，那么您可以计算4个txt文件吗？

2）当然，您需要创建一个var，而不仅仅是使用print语句 3）只需更改权限

所以，总结一下，我会用这种方法：

import os
for i, file in enumerate(os.listdir("/Users/user/Desktop/Folder")):
  if "input" in file:
    with open(file) as f:
        lines = f.readlines()

        for l in lines:
            data = ""
            data += "#!/bin/bash\n#BSUB -J",l+".sh","\n#BSUB -o /scratch/DBC/user/"+l+".sh.out\n#BSUB -e /scratch/DBC/user/"+l+".sh.err\n#BSUB -n 1\n#BSUB -q normal\n#BSUB -P DBCDOBZAK\n#BSUB -W 168:00\n"
            data += "cd /scratch/DBC/user\n"
            data += 'grep "input"'+l+" > result."+l+".txt"

            with open('script%s.sh'%i, 'w') as output:
                output.write(data)
            os.chmod("script%s.sh'%i", 700)

顺便说一句，我的代码只是一个猜测。我认为在陈述你的问题时你应该更明确。我不明白你想要达到的目标。

Answer 2

另一种解决方案，而不是创建文件

script1.sh
script2.sh
script3.sh

等。将创建一个文件文件script.sh

#!/bin/bash
#BSUB -J "$1".sh 
#BSUB -o /scratch/DBC/user/"$1".sh.out
#BSUB -e /scratch/DBC/user/"$1".sh.err
#BSUB -n 1
#BSUB -q normal
#BSUB -P DBCDOBZAK
#BSUB -W 168:00

cd /scratch/DBC/user
grep "input" "$1" > result."$1".txt

并使用

运行它

script.sh input1
script.sh input2
script.sh input3

Python：用于制作多个bash脚本的脚本

2 个答案: