考虑以下功能定义
library(doParallel)
f_print <- function(x)
{
print(x)
}
f_foreach <- function(l)
{
foreach (i=l) %do%
{
f_print(i)
}
}
f_foreach_parallel <- function(l)
{
doParallel::registerDoParallel(1)
foreach (i=l) %dopar%
{
f_print(i)
}
}
功能用途:
> f_foreach(c(1,2))
[1] 1
[1] 2
[[1]]
[1] 1
[[2]]
[1] 2
> f_foreach_parallel(c(1,2))
Show Traceback
Rerun with Debug
Error in { :
task 1 failed - "impossible de trouver la fonction "f_print""
[Error: could not find function f_print]
>
在f_print()
涉及并行性时,您能帮助解释为什么foreach
不可见吗?我们如何在此并列f_print()
中使用foreach
?与此相关的任何文档?
答案 0 :(得分:0)
除了顶级帖子的评论中已经说过的内容,特别是关于指定.export
的评论,在使用doFuture包时,无论并行后端如何,您的代码都能正常运行系统和.export
。以下是您的设置的改编版本:
f_print <- function(x) {
print(x)
}
f_foreach <- function(l) {
foreach(i=l) %do% {
f_print(i)
}
}
f_foreach_dopar <- function(l) {
foreach(i=l) %dopar% {
f_print(i)
}
}
而不是:
library("doParallel")
## Setup PSOCK workers (just as on Windows)
workers <- parallel::makeCluster(1L, outfile = "")
registerDoParallel(workers)
f_foreach_dopar(c(1,2))
## Error in { : task 1 failed - "could not find function "f_print""
你可以这样做:
library("doFuture")
registerDoFuture()
## As above
workers <- parallel::makeCluster(1L, outfile = "")
plan(cluster, workers = workers)
f_foreach_dopar(c(1,2))
## [1] 1
## [1] 2
## [[1]]
## [1] 1
##
## [[2]]
## [1] 2
这样做的原因是doFuture进行了更彻底的搜索来识别全局变量(这里是f_print()
)。
PS。 outfile = ""
的原因是实际显示stdout / stderr输出(例如来自print()
)。在并行处理中重定向stdout / stderr,我不推荐,这是一个完全不同的讨论,但我假设您仅使用print()
作为您的示例。