如何在创建汇总表时使用summarize_all提取特定值?

时间:2017-10-06 08:45:55

标签: r dplyr summarize

我的数据看起来像这样(尽管在大约12年内有数千个样本网站:

library(tidyverse)
df <- tribble(~Year, ~Sample, ~Total_A, ~Total_B, ~Total_C,
            2000, 'Riverside', 990, 08, NA,
            2000, 'Pasadena', 887, 101, 78,
            2000, 'Goleta', 786, NA, NA,
            2001, 'Riverside', 985, 89, 21,
            2001, 'Pasadena', 992, 67, 33,
            2002, 'Riverside', 991, 21, 09,
            2002, 'Goleta', 351, 34, NA,
            2002, 'Scottsdale', 345, NA, 75)

我使用了汇总所有(下面)来获取以下汇总数据表。

   library(dplyr)
   df1 <- df %>% 
    group_by(Sample) %>%
    summarize_all(funs(sum(!is.na(.)))) 

Sample, Total_A, Total_B, Total_C
Riverside, 3, 3, 2
Pasadena, 2, 2, 2
Goleta, 2, 1, 0
Scottsdale, 1, 0, 1

我想在数据表中添加一列,为每个样本提供每年可用的数据。无论如何我可以使用summarize_all(或任何其他总结命令)来做到这一点吗?我以为可能会使用&#34;粘贴唯一的$ Year&#34;但不确定这是否可行。我是R的新手,非常感谢任何指导。这是我要找的东西:

Sample, Total_A, Total_B, Total_C, Years_Available 
Riverside, 3, 3, 2, 2000/2001/2002
Pasadena, 2, 2, 2, 2000/2001
Goleta, 2, 1, 0, 2000/2002
Scottsdale, 1, 0, 1, 2002

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

你可以试试这个:

df1 <- df %>% 
  group_by(Sample) %>%
  mutate(years = toString(Year)) %>%
  group_by(Sample, years) %>%
  summarize_all(funs(sum(!is.na(.)))) 

我得到的输出是:

      Sample            years  Year Total_A Total_B Total_C
       <chr>            <chr> <int>   <int>   <int>   <int>
1     Goleta       2000, 2002     2       2       1       0
2   Pasadena       2000, 2001     2       2       2       2
3  Riverside 2000, 2001, 2002     3       3       3       2
4 Scottsdale             2002     1       1       0       1