如何在ggplot2中手动选择具有重要意义的箱形图的颜色?

时间:2017-10-04 07:10:35

标签: r ggplot2 boxplot significance facet-grid

我有一个这样的数据框:

        values    TF group_num group
1   0.22722942 FALSE         5     5
2  -0.36530296  TRUE         3     3
3   0.38795866 FALSE         4     4
4   0.48439459 FALSE         4     4
5   0.93879881 FALSE         4     4
6  -0.03598468  TRUE         4     4
7  -0.49993149 FALSE         4     4
8   1.26200426 FALSE         5     5
9  -0.02348821  TRUE         4     4
10 -0.78135675 FALSE         4     4
11 -0.00466411 FALSE         2     2
12 -0.28493506  TRUE         3     3
13 -1.41763529  TRUE         4     4
14  2.03987995 FALSE         1     1
15 -0.70235537 FALSE         3     3
16  0.36176799 FALSE         2     2
17  0.22171013 FALSE         5     5
18 -0.56860951 FALSE         4     4
19 -0.51199794  TRUE         4     4
20 -0.92628365 FALSE         4     4

group_num =数字
group = factors

所以,当我想通过使用geom_signif创建一个显示重要性的boxplot时,我在使用它时遇到错误:

ggplot(test, aes(x = TF, y = values, fill=group_num)) +
  geom_boxplot() + 
  stat_signif(comparisons=list(c('TRUE','FALSE')),map_signif_level = T) +
  facet_grid(~group_num) +
  scale_fill_manual(values=c("firebrick2","darkorchid4","dodgerblue4","deepskyblue4","gray48")) +
  theme(panel.grid.major = element_blank(), 
        panel.grid.minor = element_blank(), 
        panel.background = element_blank(), 
        axis.line = element_line(colour = "black"),
        strip.text.x = element_blank())
  

错误:提供给离散比例的连续值

因为我使用的是group_num,它是数字

但是,当我使用组(因子)时,我得到了这样的输出:

ggplot(test, aes(x = TF, y = values, fill=group)) + 
  geom_boxplot() +  
  stat_signif(comparisons=list(c('TRUE','FALSE')),map_signif_level = T)+
scale_fill_manual(values=c("firebrick2","darkorchid4","dodgerblue4","deepskyblue4","gray48"))+ 
          facet_grid(~group) + 
      scale_color_manual(values=c("firebrick2","darkorchid4","dodgerblue4","deepskyblue4","gray48")) +
      theme(panel.grid.major = element_blank(), 
            panel.grid.minor = element_blank(),
            panel.background = element_blank(), 
            axis.line = element_line(colour = "black"),
            strip.text.x = element_blank())

enter image description here

但是,我希望得到所有群体的重要观点。要做到这一点,如果我使用group_num而不选择颜色,它的工作原理。 我得到这样的输出:

ggplot(test, aes(x = TF, y = values, fill=group_num)) + 
  geom_boxplot() + 
  stat_signif(comparisons=list(c('TRUE','FALSE')),map_signif_level = T) + 
  facet_grid(~group_num) + 
  theme(panel.grid.major = element_blank(), 
        panel.grid.minor = element_blank(),
        panel.background = element_blank(),
        axis.line = element_line(colour = "black"),
        strip.text.x = element_blank())

enter image description here

所以,我的问题是我如何使用一个组(as.factor)获得一个输出,就像我使用facet_grid的所有不同组的顶部有重要意义的第一张图片一样?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

尝试在fill调用中将组geom_boxplot(作为因子)变量添加:

ggplot(test, aes(x = TF, y = values)) + 
  geom_boxplot(aes(fill=group))