过去几周我一直在学习Bokeh软件包(对于可视化,我认为非常好)。
不幸的是,我遇到了一个问题,我无法解决生活中的问题,找出解决方法。
以下两个链接很有用,但我似乎无法复制我的问题。
Using bokeh to plot interactive pie chart in Jupyter/Python - 请参阅答案#3
https://github.com/bokeh/bokeh/blob/0.12.9/examples/howto/notebook_comms/Jupyter%20Interactors.ipynb
以下代码(在Jupyter中)正确显示图形并正确显示滑块,但我不确定如何连接两者,因为当我移动滑块时,图形保持静止。
我正在使用Python 3.6和Bokeh 12.9
N = 300
source = ColumnDataSource(data={'x':random(N), 'y':random(N)})
plot = figure(plot_width=950, plot_height=400)
plot.circle(x='x', y='y', source=source)
callback = CustomJS(code="""
if (IPython.notebook.kernel !== undefined) {
var kernel = IPython.notebook.kernel;
cmd = "update_plot(" + cb_obj.value + ")";
kernel.execute(cmd, {}, {})};
""")
slider = Slider(start=100, end=1000, value=N, step=10, callback=callback)
def callback(attr, old, new):
N = slider.value
source.data={'x':random(N), 'y':random(N)}
slider.on_change('value', callback)
layout = column(slider, plot)
curdoc().add_root(layout)
show(widgetbox(slider, width = 300))
show(plot)
阅读了散景文档并阅读GitHub上的视图主题后,回调'函数对我来说有点不清楚,因为我并不完全确定要解析什么(如果事实上attr,old,new也需要解析某些元素)
非常感谢任何帮助
希望我没有错过任何明显的事情。
亲切的问候,
阿德里安
答案 0 :(得分:3)
我认为你的问题与服务器有关,尽管你有一个CustomJS和一个服务器回调。
我不熟悉以前在笔记本中使用散景服务器的方式(push_notebook
)。
新的方式是这样的:你将代码包装在一个带有一个参数(文档)的函数中,并且在该文档上调用add_layout
。然后,您使用该功能构建一个应用程序并显示它。
这给出了:
from bokeh.models import ColumnDataSource, Slider
from bokeh.layouts import column
from bokeh.plotting import figure, show, output_notebook
from numpy.random import random
from bokeh.application import Application
from bokeh.application.handlers import FunctionHandler
output_notebook()
def modify_doc(doc):
N = 300
source = ColumnDataSource(data={'x':random(N), 'y':random(N)})
plot = figure(plot_width=950, plot_height=400)
plot.circle(x='x', y='y', source=source)
slider = Slider(start=100, end=1000, value=N, step=10)
def callback(attr, old, new):
N = new # but slider.value would also work
source.data={'x': random(N), 'y': random(N)}
slider.on_change('value', callback)
layout = column(slider, plot)
doc.add_root(layout)
app = Application(FunctionHandler(modify_doc))
show(app, notebook_url="localhost:8888")
答案 1 :(得分:2)
您目前正在混合使用不同的交互方式,但不幸的是,您总是会错过每种不同的方式。
您使用的滑块来自散景,但遗憾的是,slider.on_change
只有在您运行散景服务器时才有效。来自documentation:
使用散景服务启动Bokeh服务器并使用.on_change设置事件处理程序(或者对于某些小部件,.on_click)。
我无法在运行jupyter笔记本和散景服务器上找到那么多,但this issue似乎在讨论这种可能性。它还提到bokeh.application
,但我从未使用过,所以不知道它是如何工作的。
你还使用了一个自定义的js回调,它调用jupyter内核并尝试执行update_plot(value)
,但是你从未定义过这样的函数,所以它什么也没做。
然后您需要一种方法将数据推送到输出。我想散景服务器可以以某种方式做到这一点,对于没有散景服务器push_notebook
的jupyter笔记本似乎是解决方案。请注意,您需要show(..., notebook_handle=True)
才能推送。
滑块和其他小部件会自动将其状态同步回python,因此您可以使用slider.on_change
。您不需要CustomJS。数据流应如下所示:
python script -> bokeh server -> html -> userinput -> bokeh server -> python callbacks -> bokeh server updates plots
如果您不想运行单独的进程,可以使用jupyter内核在python笔记本中执行代码。数据流:
jupyter notebook -> html -> user input -> customjs -> jupyter kernel -> python callbacks -> push_notebook to update plots
output_notebook()
N = 300
source = ColumnDataSource(data={'x':random(N), 'y':random(N)})
plot = figure(plot_width=950, plot_height=400)
plot.circle(x='x', y='y', source=source)
callback = CustomJS(code="""
if (IPython.notebook.kernel !== undefined) {
var kernel = IPython.notebook.kernel;
cmd = "update_plot(" + cb_obj.value + ")";
kernel.execute(cmd, {}, {})};
""")
slider = Slider(start=100, end=1000, value=N, step=10, callback=callback)
# must have the same name as the function that the CustomJS tries to call
def update_plot(N):
source.data={'x':random(N), 'y':random(N)}
# push notebooks to update plots
push_notebook()
layout = column(slider, plot)
# notebook_handle must be true, otherwise push_notebook will not work
h1 = show(layout, notebook_handle=True)
如果您没有与散景小部件结婚,您可以使用专为jupyter笔记本中的交互性设计的ipywidgets。数据流如下:
jupyter notebook -> html -> user input -> ipywidgets sync automatically -> python callbacks -> push_notebook
我在这里使用interact
,但其他小部件应该按预期工作。
from ipywidgets import interact
output_notebook()
N = 300
source = ColumnDataSource(data={'x':random(N), 'y':random(N)})
plot = figure(plot_width=950, plot_height=400)
plot.circle(x='x', y='y', source=source)
def update_plot(v):
N = v
print(N)
source.data={'x':random(N), 'y':random(N)}
# push changed plots to the frontend
push_notebook()
# notebook_handle must be true so that push_notebook works
show(plot, notebook_handle=True)
请注意,您需要正确安装ipywidgets,如果您不使用conda,则会调用jupyter nbextension enable --py --sys-prefix widgetsnbextension
。有关详细信息see the documentation