Pyedflib错误读取信号

Question

我有一组包含EEG信号数据的EDF文件。我使用pyedflib来访问文件，但是我经常难以从某些文件中读取信号。基本上，当我尝试读取信号值时，有许多文件可以获得所有0的数组。给出：

def get_sig(fname):
  import pyedflib
  f=pyedflib.EdfReader(fname)
  file_dur=f.getFileDuration()
  fs=int(inFile.getSignalHeader(0)['sample_rate'])
  chan_names=f.getSignalLabels()
  #note... channel names and file duration are captured correctly

  sig=f.readSignal(4)
  return sig

这会返回一个长度为＆＃39; file_dur＆＃39;的数组。 *＆＃39; fs＆＃39;，但结果是所有0的数组，并显示以下警告：

read -1, less than 8965120 requested!!!

有没有人有任何想法会导致这样的问题？不幸的是，我不能共享任何数据，因为它是PHI，但是如果有任何其他信息可能有用，那就问问。

一些额外的笔记：

1. 我还尝试sig=f.readSignal(4,start=0,n=100)以确保文件的开头或任何类型的问题都不存在问题，它会返回一个长度为100的全0的数组。
2. 当我在Matlab中检查它们时（即非零），这些值是正确的。
3. 问题似乎是文件特定的（有些是正确处理的，而有些则没有），但是我找不到实际信号值以外的文件之间的差异
4. f.readSignal(4)中使用的索引4在我的完整应用程序中没有硬编码，这仅用于演示目的（在我的示例文件中，4对应于EEG频道F4）。

谢谢！

P.S。我也将它添加到pyedflib wiki中。

Answer 1

如果使用相同的句柄，pyedflib不会在文件之间进行清理。上面的代码运行正常，但是当作为驱动程序内部的循环实现时，我没有明确关闭pyedflib文件句柄。一旦我在每个文件后添加f.close()，它就可以正常工作。