如何配置Rcpp代码（在linux上）

Question

我用Rcpp创建了一个R包，其中整个模拟在c ++中运行，结果在R中进行分析。现在我需要分析我的函数以便我可以对它们进行优化，但R剖析器无法区分C ++函数内部发生的情况，当函数只能从R里面运行时，我不知道如何运行C ++分析器。

到目前为止，我已经找到了一些使用gperftools（questions和tutorials）的建议，但指南不完整（可能他们假定我缺乏一定程度的知识？），缺少链接，我一直跑到墙上。因此这个问题。这就是我所在的地方：

1. 安装gperftools（我使用pacman从extra / gperftools安装）
2. 在C ++标题中包含gperftools / profiler.h
3. 在C ++代码中添加ProfilerStart（“myprof.log”）和ProfilerStop（）围绕我想要分析的内容
4. 使用-lprofiler编译
5. 运行“$ CPUPROFILE =”myprof.log“R -f myscript.R”

当前的墙是gcc告诉我“未定义的符号：ProfilerStart”，所以我认为链接有问题？

Answer 1

我对gperftools并没有给人留下太深刻的印象。此外，它似乎是一个仪表分析器，基于采样的分析器更易于使用，并且可能运行得更快。 Intels VTune是一款出色的基于抽样的分析器，如果您是教育用户，则可免费使用。即使您不是，您的组织也可能已拥有许可证。

转向你的gperftools问题，是的，这是一个链接器问题。由于您已决定不共享任何相关信息（链接命令？编译命令？实际错误消息？），我们无法为您提供进一步的帮助。

Answer 2

毕竟这是一个链接错误，由于我缺乏经验，因为这是我第一次使用Makevars。 在步骤＃4中，我将“-lprofiler”添加到PKG_CXXFLAGS，用于编译，我应该将其添加到PKG_LIBS。我做了改变，现在探查器工作得很好。这是我的Makevars现在：

PKG_CXXFLAGS += -Wall -pedantic -g -ggdb #-fno-inline-small-functions PKG_LIBS += -lprofiler CXX_STD = CXX11