Python igraph计算每个集群的模块性

时间:2017-09-24 23:55:48

标签: python python-3.x igraph modularity

我有一个网络,我想使用iGraph中的多级社区检测算法进行分析。我听说igraph中的多层次与Louvain方法相同。我知道Louvain方法只输出最佳模块性,但我需要知道如何输出其他集群模块性。

我尝试使用return_levels = True,但结果是

igraph.clustering.VertexClustering object at 0x117364518

如果我没有使用return_levels = True输出只显示最佳模块性

这是我的community_multilevel代码:

from igraph import *

graph= Graph.Read_Ncol('Dummy.txt',names=True,directed=False,weights=True)

implementLouvain = graph.community_multilevel()

print (implementLouvain)
outputModularity = graph.modularity(implementLouvain)
print("Modularity Optimal Value",outputModularity)

在Dummy.txt里面

a b 1
a c 1
a d 1
b d 1
c d 1
b g 1
e f 1
e g 1
e h 1
f h 1
g h 1
a g 1

输出看起来像这样

Clustering with 8 elements and 2 clusters
[0] a, b, c, d
[1] g, e, f, h

Modularity Optimal Value:  0.33333333333333337

我的目标是为每个群集输出模块化,就像这样

[0] a,b,c,d

Modularity [0]:0.xxxxxxx

我的问题有解决办法吗?还是我错过了什么? 谢谢〜

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