我需要帮助将每个相似的行分隔一个长的列表文本。任务是从一系列无组织的文件中读取并格式化它然后用相似的行分隔它。来自:
MMP,iP,c,002309.82,iS,002311.09,3208,18.87,L,
CNOP,eP,,003544.06,eS,003551.64,,151.00,,
SNP,iP,c,003552.87,iS,003605.55,1924.5,158.07,L,
GUIM,eP,,003554.16,eS,003608.49,,99.00,,
DCP,eP,c,003559.26,,,1214.0,88.89,L,
LLP,eP,c,003606.33,iS,003628.98,389.7,131.23,L,
PAGZ,eP,,003608.48,eS,003631.00,,76.00,,
MSLP,eP,,003618.28,,,,,,
OCLP,eP,,003618.78,eS,003646.82,,,,
TBP,eP,,003640.19,,,282.4,59.35,L,
TBP,eP,,012138.99,,,75.4,11.26,L,
SNP,iP,c,033417.94,iS,033420.44,1023.2,45.51,L,
TBP,eP,,033513.03,,,52.8,12.58,L,
SIPP,eP,d,043457.16,eS,043519.77,1212.00,109.75,L,
LLP,iP,c,054745.48,iS,054753.07,1588.5,65.12,L,
TBP,iP,c,054746.49,eS,054752.88,703.3,32.50,L,
MSLP,eP,,054747.92,eS,054757.96,,63.00,,
KCP,iP,d,082343.73,,,-71.96,180.11,T,
PGP,eP,d,085017.97,eS,085021.92,2428,18.5,L,
PGP,eP,d,085017.97,eS,085021.92,2428.00,18.50,L,
LLP,iP,d,095505.28,iS,095513.89,2940.7,105.86,L,
TBP,eP,c,095506.67,,,704.8,42.51,L,
...
我可以使用awk
,read -r line
条件语句和printf
来格式化所有内容。
现在我有了这个格式化文本:
TBP iP c 014449.61 iS 014455.09 2366.20 29.41 L
LLP iP d 014450.82 iS 014457.36 1414.20 82.30 L
MSLP eP 014456.98 eS 014509.62 72.00
OCLP eP 014505.60 eS 014524.97 69.00
DCP eP c 014507.15 eS 014530.52 268.80 115.79 L
GUIM eP 014514.78 eS 014534.25
PAGZ eP 014520.03 eS 014546.38
BUKP eP 014520.40 eS 014546.68
CVP iP d 015016.91 iS 015037.11 3695.00 162.54 L
SIPP iP c 020817.81 T
BBPS eP 025007.36 eS 025022.74 310.00
SGCP eP 025009.43 eS 025025.00 258.00
APYP eP 025013.77 eS 025033.51 294.00
SIPP eP c 025017.98 eS 025049.24 32739.00 267.36 L
ABRA eP 025018.32 317.00
CAUP eP 025027.99 317.00
SMPP eP 025038.70 eS 025116.93
BOLP eP 025039.33 eS 025116.19 331.00
BALP eP 025042.59 eS 025125.51 280.00
PCP eP c 025046.89 eS 025132.15 543.00 249.71 L
LQP eP c 025105.80 1888.00 269.35 L
TGY eP c 025107.21 1728.00 183.40 L
GQP eP c 025109.23 eS 025210.11 1481.10 180.41 L
KCP iP d 025249.58 -41.73 324.15 T
LUBP eP 043452.34 eS 043459.96 68.00
PGP eP c 043456.97 eS 043501.27 42702.00 196.60 L
TGY eP d 043457.41 eS 043507.61 33835.00 157.27 L
LQP iP d 043502.88 iS 043517.81 6307.00 168.13 L
...
现在我陷入行分离。分离的关键决定因素是$4
列的前4个字符。我尝试隔离$4
,然后将前4个字符作为比较基础:
自:
014449.61
014450.82
014456.98
014505.60
014507.15
014514.78
014520.03
014520.40
015016.91
...
要:
0144
0144
0144
0145
0145
0145
0145
0145
0150
...
但我不知道如何比较和完全追加它们。虽然可以使用uniq
进行比较,但我不能像我希望的那样将它们附加在一起。
我希望的输出是:
2014Sept01 0144
TBP iP c 014449.61 iS 014455.09 2366.20 29.41 L
LLP iP d 014450.82 iS 014457.36 1414.20 82.30 L
MSLP eP 014456.98 eS 014509.62 72.00
2014Sept01 0145
OCLP eP 014505.60 eS 014524.97 69.00
DCP eP c 014507.15 eS 014530.52 268.80 115.79 L
GUIM eP 014514.78 eS 014534.25
PAGZ eP 014520.03 eS 014546.38
BUKP eP 014520.40 eS 014546.68
2014Sept01 0250
BBPS eP 025007.36 eS 025022.74 310.00
SGCP eP 025009.43 eS 025025.00 258.00
APYP eP 025013.77 eS 025033.51 294.00
SIPP eP c 025017.98 eS 025049.24 32739.00 267.36 L
ABRA eP 025018.32 317.00
CAUP eP 025027.99 317.00
SMPP eP 025038.70 eS 025116.93
BOLP eP 025039.33 eS 025116.19 331.00
BALP eP 025042.59 eS 025125.51 280.00
PCP eP c 025046.89 eS 025132.15 543.00 249.71 L
2014Sept01 0251
LQP eP c 025105.80 1888.00 269.35 L
TGY eP c 025107.21 1728.00 183.40 L
GQP eP c 025109.23 eS 025210.11 1481.10 180.41 L
2014Sept01 0252
KCP iP d 025249.58 -41.73 324.15 T
2014Sept01 0434
LUBP eP 043452.34 eS 043459.96 68.00
PGP eP c 043456.97 eS 043501.27 42702.00 196.60 L
TGY eP d 043457.41 eS 043507.61 33835.00 157.27 L
2014Sept01 0435
LQP iP d 043502.88 iS 043517.81 6307.00 168.13 L
BOAC eP 043503.74 eS 043519.98 139.00
BUSP eP 043507.46 eS 043527.58 146.00
OTRP eP 043512.77 eS 043535.66 97.00
GQP eP d 043513.54 iS 043537.15 714.60 117.54 L
PCP eP c 043514.59 eS 043538.74 441.00 151.61 L
BALP eP 043521.07 eS 043550.06 172.00
ENPP eP 043521.51 eS 043546.79
SMPP eP 043521.96 eS 043551.39 341.00
JAP eP d 043522.67 2732.70 161.82 L
CUYO eP 043522.99 160.00
CAUP eP 043536.77 eS 043616.73 210.00
...
标题只能使用echo
附加,但问题是将$4
中的每个相似切割行分开,然后附加下一组相似的切割行。我仍然不知道如何循环这个任务。
感谢任何帮助。 非常感谢你。
答案 0 :(得分:0)
您可以在处理之前使用sort
对输入进行排序。这将使相似的线条彼此相邻,并解决您的问题。
由于您没有在行的开头排序,因此您需要-t
将字段分隔符设置为逗号,并-k
告诉它根据第四个字段进行排序。< / p>
sort -t, -k4,4
之类的东西应该有用(未经测试)。
答案 1 :(得分:0)
在awk中。使用第一个文件(2014Sept01
来自哪里?):
$ awk '
BEGIN { FS=","; OFS="\t" } # tabs as output delimiter, not pixel perfect, column might help
{
g=substr($4,1,4) # 4 chars from $4 to grouper
}
g!=p || NR==1 { # if grouper changes or NR==1
print (NR==1?"":ORS) g # print grouper and and extra newline
p=g # store previous grouper to detect change
}
{
$1=$1 # rebuild record for OFS
print # output
}' <(sort -t, -k4n file) # sort file on 4th column
# | column # try to pipe the above to column?
0023
MMP iP c 002309.82 iS 002311.09 3208 18.87 L
0035
CNOP eP 003544.06 eS 003551.64 151.00
SNP iP c 003552.87 iS 003605.55 1924.5 158.07 L
GUIM eP 003554.16 eS 003608.49 99.00
DCP eP c 003559.26 1214.0 88.89 L
0036
...