如何用python解压缩内存中的* .bz2文件? bz2文件来自csv文件。
我使用下面的代码在内存中解压缩它,它可以工作,但它带来了一些脏数据,如csv文件的文件名和它的作者名称,有没有其他更好的方法来处理它?
#!/usr/bin/python
# -*- coding: utf-8 -*-
import StringIO
import bz2
with open("/app/tmp/res_test.tar.bz2", "rb") as f:
content = f.read()
compressedFile = StringIO.StringIO(content)
decompressedFile = bz2.decompress(compressedFile.buf)
compressedFile.seek(0)
with open("/app/tmp/decompress_test", 'w') as outfile:
outfile.write(decompressedFile)
我发现this question,它是gzip,但我的数据是bz2格式,我尝试按照其中的说明进行操作,但似乎bz2无法以这种方式处理它。
编辑:
无论@metatoaster的答案还是上面的代码,它们都会将更多脏数据带入最终的解压缩文件中。 例如:我的原始数据附加在下面,并以csv格式附加名称res_test.csv:
然后我进入文件所在的目录并用tar -cjf res_test.tar.bz2 res_test.csv
压缩它并获取压缩文件res_test.tar.bz2,这个文件可以模拟我将从互联网获取的bz2数据,我希望在内存中解压缩它而不先将其缓存到磁盘中,但我得到的是下面的数据并包含太多脏数据:
数据仍然存在,但是淹没在噪声中,是否可以将其解压缩为与原始数据相同的纯数据,而不是将其解压缩并从过多的噪声中提取实际数据?
答案 0 :(得分:2)
对于通用bz2解压缩,可以使用BZ2File
类。
from bz2 import BZ2File
with BZ2File("/app/tmp/res_test.tar.bz2") as f:
content = f.read()
content
应包含文件的解压缩内容。
但是,假设这是一个tar
文件(通常作为文件目录提取到磁盘的存档文件),可以使用tarfile
模块,它具有扩展模式处理bz2的标志。假设目标文件包含res_test.csv
,则可以使用以下内容
tf = tarfile.open('/app/tmp/res_test.tar.bz2', 'r:bz2')
csvfile = tf.extractfile('res_test.csv').read()
r:bz2
标志以一种可以向后搜索的方式打开tar存档,这很重要,因为替代方法r|bz2
使得从返回的成员调用提取文件变得不切实际。 extractfile
。第二行只是调用extractfile
将'res_test.csv'
的内容作为字符串从存档文件中返回。
通常建议使用透明打开模式('r:*'
),因此如果使用gzip压缩输入tar文件,则不会遇到任何故障。
当然,tarfile
模块具有较低级别open
方法,可用于任意流对象。如果文件已经使用BZ2File
打开,也可以使用
with BZ2File("/app/tmp/res_test.tar.bz2") as f:
tf = tarfile.open(fileobj=f, mode='r:')
csvfile = tf.extractfile('res_test.csv').read()