如何在R包中加载依赖项？

Question

我正在开发一个R包，可在DESCRIPTIONS文件

中找到

Imports: 
    dplyr,
    ggplot2,
    ncdf4

我有一个示例函数，我使用第三个依赖

testFun <- function(file, lat, long){
  ncfname <- file.path(file,fsep = .Platform$file.sep)
  xfile <- nc_open(ncfname) #Opens the NetCDF file
  lat <- ncvar_get(xfile, 'lat') #Extracts all latitudes

  ...Calculations

  return(XYZ)
}

当我Build and Reload包时，我运行该功能时，could not find function "nc_open"。

但是，当我用ncdf4::nc_open

替换它时，它会起作用

我应该在packagename::前加上我在代码中使用的每个依赖项吗？或者我错过了什么？

通常，我希望从DESCRIPTIONS安装所有依赖项，并且可以使用它的函数，而不需要每次都使用包前缀。

Answer 1

或者：

• 使用来自ncdf4::nc_open(...)
的包明确地为函数添加前缀

或者：

• 在您的NAMESPACE文件importFrom(ncdf4, nc_open)中添加一行，然后在您的代码中调用不带包的函数：nc_open(...)

您可以使用importFrom来搜索该软件包中的所有内容，而不是为要导入的每个函数添加import(ncdf4)行。

Answer 2

最简单的方法和最正确的方法是直接从包中取出您的功能，而无需打开任何可能会消除某人当前环境的包裹。

试试这个：

xfile <- ncdf4::nc_open(ncfname)

它应该无冲突地访问您需要的内容。这是当前首选的方法，因为它留下了为用户找到的东西。它还使人们很容易知道他们去探索时会发生什么。