我有大型pandas DataFrames和财务数据。 我没有问题附加和连接其他列和DataFrame到我的.h5文件。
财务数据每分钟都在更新,我需要每分钟向我的.h5文件中的所有现有表附加一行数据。
这是我到目前为止所尝试的内容,但无论我做什么,它都会覆盖.h5文件而不只是附加数据。
HDFStore方式:
#we open the hdf5 file
save_hdf = HDFStore('test.h5')
ohlcv_candle.to_hdf('test.h5')
#we give the dataframe a key value
#format=table so we can append data
save_hdf.put('name_of_frame',ohlcv_candle, format='table', data_columns=True)
#we print our dataframe by calling the hdf file with the key
#just doing this as a test
print(save_hdf['name_of_frame'])
我试过的其他方式,to_hdf:
#format=t so we can append data , mode=r+ to specify the file exists and
#we want to append to it
tohlcv_candle.to_hdf('test.h5',key='this_is_a_key', mode='r+', format='t')
#again just printing to check if it worked
print(pd.read_hdf('test.h5', key='this_is_a_key'))
以下是read_hdf之后的一个DataFrame:
time open high low close volume PP
0 1505305260 3137.89 3147.15 3121.17 3146.94 6.205397 3138.420000
1 1505305320 3146.86 3159.99 3130.00 3159.88 8.935962 3149.956667
2 1505305380 3159.96 3160.00 3159.37 3159.66 4.524017 3159.676667
3 1505305440 3159.66 3175.51 3151.08 3175.51 8.717610 3167.366667
4 1505305500 3175.25 3175.53 3170.44 3175.53 3.187453 3173.833333
下次我获取数据时(每分钟),我想在我所有列的索引5中添加一行...然后是6和7 ..依此类推,无需阅读和操作内存中的整个文件会破坏这样做的目的。 如果有更好的解决方法,请不要羞于推荐它。
P.S。抱歉在这里格式化该表
答案 0 :(得分:8)
pandas.HDFStore.put()有参数synchronized
(默认为append
) - 指示Pandas覆盖而不是附加。
所以试试这个:
False
我们也可以使用store = pd.HDFStore('test.h5')
store.append('name_of_frame', ohlcv_candle, format='t', data_columns=True)
,但也应该以表格格式创建此文件:
store.put(..., append=True)
注意:附加仅适用于store.put('name_of_frame', ohlcv_candle, format='t', append=True, data_columns=True)
(table
- 是format='t'
)格式的别名。
答案 1 :(得分:2)
tohlcv_candle.to_hdf('test.h5',key='this_is_a_key', append=True, mode='r+', format='t')
您需要传递另一个参数 append=True
,以指定将数据附加到现有数据(如果在该键下找到),而不是覆盖它。
如果没有这个,默认值为False
,如果它遇到'this_is_a_key'
下的现有表,则会覆盖它。
mode=
参数仅在文件级别,告知是否要覆盖或追加整个文件。
一个文件可以包含任意数量的密钥,因此mode='a', append=False
设置意味着只有一个密钥被覆盖而其他密钥保留。
我有与您相似的经历,并在参考文档中找到了额外的追加参数。设置完成后,现在它正好适合我。
参考:https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/generated/pandas.DataFrame.to_hdf.html
注意:hdf5不会对数据帧的索引做任何事情。我们需要在将数据放入或放出数据之前对其进行处理。