rmarkdown .rmd文件中的Rstudio文件名完成

时间:2017-09-13 10:30:43

标签: r rstudio r-markdown

在Rstudio版本(1.0.143)。

我正在使用Rstudio包项目并在其中使用Rmarkdown。所有代码文件都在./R文件夹中。所有数据文件都在./Data文件夹中。默认getwd()是父文件夹./(包含./R和./Data)。

我在RStudio中使用文件完成工具,我认为它非常有用。但是在.Rmd文件中,它无法按预期工作。例如,以下是两种情况:

  • 在.R文件中,包含在./R文件夹中。我打开括号和 相对于getwd(),完成按照预期工作 文件夹,即父母。因此./R中的文件“hello.R”将完成 “./R/hello.R”

  • 在.Rm文件中,也包含在./R文件夹中。我开始一个R块。一世 打开括号,完成不会给我“./R” 文件夹,即使getwd()给父母“./”, 完成./R中的文件“hello.R”给出“hello.R”。

这是一个已知错误还是一个功能?

> sessionInfo() 
R version 3.4.1 (2017-06-30) Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

Matrix products: default

locale: [1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252 [4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages: [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):  [1] Rcpp_0.12.12        compiler_3.4.1      RColorBrewer_1.1-2  plyr_1.8.4          base64enc_0.1-3     tools_3.4.1         rpart_4.1-11         [8] digest_0.6.12       evaluate_0.10.1     tibble_1.3.4        gtable_0.2.0        htmlTable_1.9       checkmate_1.8.3     lattice_0.20-35     [15] rlang_0.1.2         Matrix_1.2-11       gridExtra_2.2.1     stringr_1.2.0       cluster_2.0.6       knitr_1.17 htmlwidgets_0.9     [22] grid_3.4.1          nnet_7.3-12         data.table_1.10.4   survival_2.41-3     foreign_0.8-69      pacman_0.4.6        latticeExtra_0.6-28 [29] Formula_1.2-2       ggplot2_2.2.1       magrittr_1.5        Hmisc_4.0-3         scales_0.5.0        backports_1.1.0     htmltools_0.3.6     [36] splines_3.4.1       colorspace_1.3-2    stringi_1.1.5       acepack_1.4.1       lazyeval_0.2.0      munsell_0.4.3

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

RStudio文件名完成基于当前工作目录,即你自己确定的getwd()

编织Rmd文件时,包含Rmd文件的目录将用作工作目录。因此,当您在./R中找到您的Rmd文件时,这将成为您的工作目录。

最简单的解决方案是在开发Rmd文件时将工作目录更改为./R

您可以选择进行调查。 RStudio使用rmarkdown包中的render。参见例如?rmarkdown::render;看knit_root_dir。 这也适用于您的编织文档

knit::opts_knit$set(root.dir='../')

编辑: 似乎RStudio(v.1.0.136)足够聪明,可以识别出knitr文档将根据其目录进行编织,从而使用来自 目录的自动完成,而不是getwd()