R parallel:HPC中反序列化(节点$ con)出错

时间:2017-09-12 22:46:38

标签: r multithreading hpc

我正在使用R:

在HPC群集上运行多核功能
library(parallel)
Myfunc(data, parameters=1:n, mc.cores=n_cores)

Myfunc来自一个支持多线程的库,并循环访问参数1:n,即mod(n,n_cores)= 0。我收到以下错误:

Error in unserialize(node$con) : error reading from connection
Calls: FindTopicsNumber ... FUN -> recvData -> recvData.SOCKnode -> unserialize
Execution halted

我在之前的问题Parallel and Multicore Processing in R中尝试过使用mclapply但不起作用的解决方案。我错过了初始化多核的东西吗?

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