Question

我有40个文件夹（COPD1 ... COPD40），所有文件夹都有一个名为summary.txt的文件。我想在所有这些文件夹中提取最后一行的最后一个元素（例如“90％”）。我知道怎么做一次：

awk '/Overall alignment rate:/{print $NF}' summary.txt

我不确定如何对所有40个文件夹执行此操作，并将提取的元素附加到新的.txt文件，以便最终产品如下所示：

COPD1 98%
COPD2 96%
...
COPD40 97.5%

任何帮助都将不胜感激。

Answer 1

$ awk '/Overall alignment rate:/{print FILENAME,$NF}' COPD*/summary.txt
COPD1/summary.txt 90%
COPD2/summary.txt 90%
COPD3/summary.txt 90%
[...snip...]

注意：

Awk有一个变量FILENAME，这是当前的文件名。
shell glob COPD*/summary.txt将扩展为名为summary.txt的所有文件，这些文件位于以COPD开头的目录中。

文档

来自POSIX spec for awk：

FILENAME
当前输入文件的路径名。在一个开始动作值未定义。在END动作中，值应为处理的最后一个输入文件的名称。

Answer 2

请你也试试。

awk 'val && FNR==1{close(val)} /Overall alignment rate:/{print FILENAME,$NF;val=FILENAME;nextfile}' COPD*/summary.txt

所以我在这里关闭文件（将在后端打开，如果在目录中有太多文件，可能会产生问题）。此外，因为我们只是寻找字符串（整体对齐率:)，如果它发现它关键字nextfile将跳转到下一个文件然后（所以我们可以通过NOT读取完整文件一旦获得匹配字符串来节省一些周期）。

在许多文件夹中的同一文件上执行awk命令并附加输出

2 个答案:

文档