Question

我有一个Filemaker Pro 12肺癌患者的关系数据库，接受手术治疗。因为一名患者可能在一次或多次手术中移除一种或多种癌症等，患者特征/人口统计数据在一个表格（患者）中，他们所拥有的手术在另一个表格（治疗）中由PatientID和癌症相关联特征在另一个表（病理学）中由PatientID识别，但通过手术台的SurgeryID与癌症被移除相关联。

我希望将所有“内部连接”数据备份为平面文件，其中包含每种不同癌症的记录以及每位患者的每项操作（因此，如果患有多种癌症和/或手术，将会有多个相同的患者记录）。

因此我使用以下方法导入了3个Filemaker表患者，治疗，病理学

con = odbcConnect("LC", uid = "uid", pwd = "pwd")
PatSurg <-sqlQuery(con, paste("SELECT * FROM Patient P INNER JOIN Treatment T ON P.PatientID = T.PatientID"))
PatPath <-sqlQuery(con, paste("SELECT * FROM Patient P INNER JOIN Pathology H ON P.PatientID = H.PatientID"))
Full <- merge(PatSurg, PatPath, by = intersect(names(PatSurg), names(PatPath)))
View(Full)

这成功地创建了数据框（完整），就像我想要保存到一个空的现有Filemaker Pro数据库中的数据框一样，该数据库具有相同的列名和一个表Thoracic。

然后我想我会尝试简单的指令：

sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic")

并返回错误：

sqlSave中的错误（con，Full，tablename =“Thoracic”）：table '胸部'已经存在

没有被吓倒，我删掉了表名并重新保存了它：

sqlDrop(con, "Thoracic", errors = FALSE)
sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic")

返回了一个新错误：

sqlSave中的错误（con，Full，tablename =“Thoracic”）：[RODBC] 更新HY000 502中的exec失败[FileMaker] [FileMaker]（502）：字段数值验证测试失败

然后我想，也许我应该使用sqlQuery命令和INSERT，但是当作为SQL / ODBC的表达式时，我不确定如何引用我的R数据帧。我试过了：

sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic ", Full)
sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic VALUES", Full)

两人都回复了：

if（errors）返回错误（odbcGetErrMsg（channel））else return（不可见（stat））：参数不可解释为逻辑另外：警告信息：在if（错误） return（odbcGetErrMsg（channel））else return（invisible（stat））:. 条件的长度> 1，只使用第一个元素

sqlAppendTable(con, "Thoracic", Full)

返回：

（函数（classes，fdef，mtable）中的错误：无法找到函数'sqlAppendTable'的继承方法用于签名'“RODBC”'

sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic VALUES Full")

返回：

[1]“42000 8310 [FileMaker] [FileMaker] FQL0001 /（1:29）：有一个查询语法中的错误。“[2]”[RODBC]错误：不能 SQLExecDirect'插入胸部值满''

我应该如何在SQL查询中引用我的R数据框“Full”。我看到的所有问题仅涉及将数据从OBDC源导入数据帧。那是最简单的一点！

Answer 1

我找到了明显的解决方法

我已安装WriteXLS并将数据框导出到XLSX文件，然后使用第一行作为列名导入：

install.packages("WriteXLS")
library(WriteXLS)
WriteXLS(Full, "SQL Backup.xlsx")

然后使用Filemaker Pro的导入功能。包含某些字符的自由文本存在一些问题，并且无论原始格式如何，日期都以yyyy-mm-dd格式返回。主要问题是如果自由文本包含分隔符，则可能存在行内右帧移位，因此应该是最后一列。我刚刚更正了XLSX文件中的那些并重新导入为基于PatientID，SurgeryID和DiagnosisID的更新。

Addit：实际上，我发现以.csv出口可以解决这些小问题。

无法使用SQL和ODBC连接将R数据框保存到filemaker Pro数据库

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