我是熊猫新手,我不知道最好的方法。
我有两个文件,我放在两个不同的数据框中:
>> frame1.head()
Out[64]:
Date and Time Sample Unnamed: 2
0 05/18/2017 08:38:37:490 163.7 NaN
1 05/18/2017 08:39:37:490 164.5 NaN
2 05/18/2017 08:40:37:490 148.7 NaN
3 05/18/2017 08:41:37:490 111.2 NaN
4 05/18/2017 08:42:37:490 83.6 NaN
>>frame2.head()
Out[66]:
Date and Time Sample Unnamed: 2
0 05/18/2017 08:38:38:490 7.5 NaN
1 05/18/2017 08:39:38:490 7.5 NaN
2 05/18/2017 08:40:38:490 7.5 NaN
3 05/18/2017 08:41:38:490 7.5 NaN
4 05/18/2017 08:42:38:490 7.5 NaN
我需要“合并”第1帧中的任何行,第2帧中的任何行,彼此相差一秒。
例如, 第1帧的这一行:
0 05/18/2017 08:38:37:490 163.7 NaN
在第2帧的这一行的一秒内:
0 05/18/2017 08:38:38:490 7.5 NaN
所以当他们“合并”时输出应该是这样的:
0 05/18/2017 08:38:37:490 163.7 7.5 NaN NaN
换句话说,一行将其时间替换为另一行,并且所有剩余列都只是附加
我最接近的是做类似的事情:
d3 = pd.merge(frame1, frame2, on='Date and Time (MM/DD/YYYY HH:MM:SS:sss)', how='outer')
>>d3.head()
Date and Time Sample_x Unnamed: 2_x Sample_y Unnamed: 2_y
0 05/18/2017 08:38:37:490 163.7 NaN NaN NaN
1 05/18/2017 08:39:37:490 164.5 NaN NaN NaN
2 05/18/2017 08:40:37:490 148.7 NaN NaN NaN
3 05/18/2017 08:41:37:490 111.2 NaN NaN NaN
4 05/18/2017 08:42:37:490 83.6 NaN NaN NaN
但是,这不是条件合并 ..我需要合并,如果它们在一秒之内,而不是完全相同。
我知道我可以将时间与以下内容进行比较:
def compare_time(temp, sec=1):
return abs(current - temp) <= datetime.timedelta(seconds=sec)
然后使用.apply()或其他东西......但我不知道如何将所有这些拼凑在一起
编辑:看起来pd.merge_asof做得很好,但我还需要保留最终帧中不匹配/合并的行
编辑2:
df1 = pd.DataFrame({ 'datetime':pd.date_range('1-1-2017', periods= 4,freq='s'),
'sample': np.arange(4)+100 })
df2 = pd.DataFrame({ 'datetime':pd.date_range('1-1-2017', periods=4,freq='300ms'),
'sample': np.arange(4) })
blah = pd.merge_asof( df2, df1, on='datetime', tolerance=pd.Timedelta('1s') ) \
.append(df1.rename(columns={'sample':'sample_x'})).drop_duplicates('sample_x')
blah
返回:
datetime sample_x sample_y
0 2017-01-01 00:00:00.000 0 100.0
1 2017-01-01 00:00:00.300 1 100.0
2 2017-01-01 00:00:00.600 2 100.0
3 2017-01-01 00:00:00.900 3 100.0
0 2017-01-01 00:00:00.000 100 NaN
1 2017-01-01 00:00:01.000 101 NaN
2 2017-01-01 00:00:02.000 102 NaN
3 2017-01-01 00:00:03.000 103 NaN
注意它保留了原始行索引(零列出两次)..
答案 0 :(得分:1)
您可以使用merge_asof
作为@Wen建议,但请务必为tolerance
指定可选值。另请考虑为匹配的direction
设置选项值,可以是“后退”(默认),“最近”或“前进”。
pd.merge_asof( df1, df2, on='datetime', tolerance=pd.Timedelta('1s') )
以下是对样本数据的更长解释(注意我只是创建新的样本数据,因为我只能看到实际数据的前几行):
df1 = pd.DataFrame({ 'datetime':pd.date_range('1-1-2017', periods= 4,freq='s'),
'sample': np.arange(4)+100 })
df2 = pd.DataFrame({ 'datetime':pd.date_range('1-1-2017', periods=4,freq='300ms'),
'sample': np.arange(4) })
df1
Out[208]:
datetime sample
0 2017-01-01 00:00:00 100
1 2017-01-01 00:00:01 101
2 2017-01-01 00:00:02 102
3 2017-01-01 00:00:03 103
df2
Out[209]:
datetime sample
0 2017-01-01 00:00:00.000 0
1 2017-01-01 00:00:00.300 1
2 2017-01-01 00:00:00.600 2
3 2017-01-01 00:00:00.900 3
pd.merge_asof( df1, df2, on='datetime', tolerance=pd.Timedelta('1s') )
Out[210]:
datetime sample_x sample_y
0 2017-01-01 00:00:00 100 0.0
1 2017-01-01 00:00:01 101 3.0
2 2017-01-01 00:00:02 102 NaN
3 2017-01-01 00:00:03 103 NaN
请注意merge_asof
执行左连接,因此您可以通过更改df1&amp;的顺序来获得不同的答案。 DF2:
pd.merge_asof( df2, df1, on='datetime', tolerance=pd.Timedelta('1s') )
Out[218]:
datetime sample_x sample_y
0 2017-01-01 00:00:00.000 0 100
1 2017-01-01 00:00:00.300 1 100
2 2017-01-01 00:00:00.600 2 100
3 2017-01-01 00:00:00.900 3 100
编辑添加:文档说merge_asof
按设计执行左连接,但它似乎与真正的左连接不同,因为它排除了左数据框中的行'匹配。要解决这个问题,你可以这样做:
pd.merge_asof( df1, df2, on='datetime', tolerance=pd.Timedelta('1s') ) \
.append(df1.rename(columns={'sample':'sample_x'})).drop_duplicates('sample_x')
Out[236]:
datetime sample_x sample_y
0 2017-01-01 00:00:00 100 0.0
1 2017-01-01 00:00:01 101 3.0
2 2017-01-01 00:00:02 102 NaN
3 2017-01-01 00:00:03 103 NaN
请注意,您可能需要根据您是否拥有唯一索引和/或唯一列来调整drop_duplicates
。