以下是我遇到的问题的背景信息:
1)输出是一个单元格数组,每个单元格包含一个size = 1024 x 1024的矩阵,type = double
2)labelbout是一个与输出相同的单元格数组,除了每个矩阵已被二值化。
3)我使用函数regionprops为每个输出单元提取ROI的平均强度和质心值(每个图像中有多个ROI)
4)道具是一个5 x 1结构,有2个场(质心和平均强度)
问题:我想在每个矩阵中获取每个ROI的平均强度值并导出到excel。以下是我到目前为止的情况:
for i = 1:size(output,2)
props = regionprops(labelboutput{1,i},output{1,i},'MeanIntensity','Centroid');
end
for i = 1:size(output,2)
meanValues = getfield(props(1:length(props),'MeanIntensity'));
end
writetable(struct2table(props), 'advanced_test.xlsx');
似乎有一些问题:
1)我的getfield命令无效并收到错误:“索引超出矩阵维度”
2)当信息存储到props中时,它会覆盖每个矩阵的值。如何制作5 x n的道具(其中n =输出中的单元格数量)?
请帮助!!
答案 0 :(得分:1)
1)我的getfield命令无效并收到错误:“索引超出矩阵维度”
从结构数组中的同一字段中获取数值的更简单方法,如数组:[structArray.fieldName]
。在你的情况下,这将是:
meanValues = [props.MeanIntensity];
2)当信息存储到props中时,它会覆盖每个矩阵的值。如何制作5 x n的道具(其中n =输出中的单元格数)? 一种选择是预先分配必要维度的空单元格,然后用
regionprops
输出填充它。像这样:
props = cell(size(output,1),1);
for k = 1:size(output,2)
props{k} = regionprops(labelboutput{1,k},output{1,k},'MeanIntensity','Centroid');
end
for k = 1:size(output,2)
meanValues = [props{k}.MeanIntensity];
end
...
另一种选择是组合循环,以便在覆盖之前使用矩阵数据。像这样:
for i = 1:size(output,2)
props = regionprops(labelboutput{1,i},output{1,i},'MeanIntensity','Centroid');
meanValues = [props.MeanIntensity];
% update this call to place props in non-overlapping parts of your file (e.g. append)
% writetable(struct2table(props), 'advanced_test.xlsx');
end
关于第二个问题的坏处是它在你的循环中有一个文件I / O步骤,它可以真正减慢速度;更不用说你将需要缩减你的可写电话,以便将结果表放在'advanced_test.xlsx'
的非重叠区域。