在R中使用fread时，如何处理分隔符之间没有空格的数据

Question

我正在通过.txt将R个大文件（> 1GB）读入fread。我正在通过bash命令直接从.zip存档中读取文件：

base = fread('unzip -p Folder.zip File.txt', sep = '|', header = FALSE, 
stringsAsFactors = FALSE, na.strings="", quote = "", col.names = col_namesMain)

文本文件通过|分隔条目，以便典型的行看起来像：

RRX|||02020||333293||||12123

然而，有很多地方空的条目由分隔符表示，它们之间没有空格，例如上面的示例行中的||。

使用fread时，通常会完全读取这些相邻的分隔符，以便上面的行返回以下条目：

RRX, ||02020|, 333293|||, 12123

什么时候应该读作：

RRX, NA, NA, 02020, NA, 333293, NA, NA, NA, 12123

我尝试将read.table与skipNul = TRUE选项一起使用，这非常有效。但是，skipNul似乎没有类似于fread的任何选项。如果可能的话，我更愿意使用fread而不是read.table，因为我有几个非常大的文件。尽管我在寻找，但我还没有对这个问题进行过多次讨论。任何帮助非常感谢。

Answer 1

  

我尝试将read.table与skipNul = TRUE选项一起使用，并且   完美地工作。但是，似乎没有类似的选择   跳过以获取恐惧。

此问题已在2019年4月15日的dev 1.12.3中修复（请参见NEWS）：

  

  
1. fread（）现在跳过嵌入式NUL（\ 0）＃3400。感谢Marcus Davy提供的示例报告，以及Roy Storey的初始PR。