问题:
Error compiling Cython file:
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...
cpdef Py_GetRemoteDevice(PyChannel Chan):
ret_val = mod_one.PyRemoteDevice()
cdef core.RemoteDevice * tmp
with nogil:
tmp = core.GetRemoteDevice(Chan.__instance)
ret_val.__set_ptr(tmp)
^
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core/mod_two.pyx:11589:25: Cannot convert 'RemoteDevice *' to Python object
背景: 我有一个相当大的C库我用Cython包装。最初我 拥有两个文件中的所有内容,core.pyx和core.pxd。但是,越多 包含较大的core.c文件生成的库。 250万行和计数。编译时间和内存使用量变为 繁琐。
我决定将内容分成多个.pyx文件。当使用的东西时 工作停止了工作。
声明: 请记住,我已经大大简化了这个问题。 包装的库有点大而且专有。
详细信息:
core.pxd - 包含C库中的所有必要组件
我是包装的。也是一个简单的Void *包装类声明。
cdef class Void:
cdef void *__void
cdef __set_ptr(self, void *ptr)
cdef extern from "core.h":
ctypedef unsigned char U8
ctypedef unsigned int U32
void OS_MemSet(U8 *dest, U8 byte, U32 len) nogil
cdef extern from "mod_one.h":
cdef struct _RemoteDevice
ctypedef _RemoteDevice RemoteDevice
cdef extern from "mod_two.h":
cdef struct _Channel
ctypedef _Channel Channel
core.pyx - 这里不需要很多,真的只是 实现Void *包装器。
cdef class Void:
cdef __set_ptr(self, void *ptr):
self.__void = ptr
mod_one.pxd - 声明RemoteDevice C结构的包装类
cimport core
cdef class PyRemoteDevice:
cdef core.RemoteDevice *__instance
cdef __set_ptr(self, core.RemoteDevice *ptr)
mod_one.pyx - 定义RemoteDevice包装类。请注意 __set_ptr函数,即cdef' d并采用RemoteDevice *
from cpython.mem cimport PyMem_Malloc, PyMem_Free
import core
cimport core
cdef class PyRemoteDevice:
def __cinit__(self):
self.__instance = <core.RemoteDevice *>PyMem_Malloc(sizeof(core.RemoteDevice))
def __init__(self):
core.OS_MemSet(<core.U8 *>self.__instance, <core.U8>0, sizeof(core.RemoteDevice))
cdef __set_ptr(self, core.RemoteDevice *ptr):
self.__instance = ptr
def __dealloc__(self):
if self.__instance is not NULL:
PyMem_Free(self.__instance)
self.__instance = NULL
mod_two.pxd - 声明了Channel包装器类,我只展示了它 这是因为它在导致我出问题的函数中使用了它。
cimport core
cimport mod_one
cdef class PyChannel:
cdef core.Channel *__instance
cdef __set_ptr(self, core.Channel *ptr)
mod_two.pyx - 定义Channel包装器类,并声明 Py_GetRemoteDevice函数,它包装了GetRemoteDevice函数 来自C库。
from cpython.mem cimport PyMem_Malloc, PyMem_Free import core cimport core import mod_one cimport mod_one
cdef class PyChannel:
def __cinit__(self):
self.__instance = <core.Channel *>PyMem_Malloc(sizeof(core.Channel))
def __init__(self):
core.OS_MemSet(<core.U8 *>self.__instance, <core.U8>0, sizeof(core.Channel))
cdef __set_ptr(self, core.Channel *ptr):
self.__instance = ptr
def __dealloc__(self):
if self.__instance is not NULL:
PyMem_Free(self.__instance)
self.__instance = NULL
cpdef Py_GetRemoteDevice(PyChannel Chan):
ret_val = mod_one.PyRemoteDevice()
cdef core.RemoteDevice * tmp
with nogil:
tmp = core.GetRemoteDevice(Chan.__instance)
ret_val.__set_ptr(tmp)
return ret_val
我遇到的问题是,当Cythonizing mod_two时,我得到了 以下错误:
Error compiling Cython file:
------------------------------------------------------------
...
cpdef Py_GetRemoteDevice(PyChannel Chan):
ret_val = mod_one.PyRemoteDevice()
cdef core.RemoteDevice * tmp
with nogil:
tmp = core.GetRemoteDevice(Chan.__instance)
ret_val.__set_ptr(tmp)
^
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core/mod_two.pyx:11589:25: Cannot convert 'RemoteDevice *' to Python object
我有点困惑,因为当我把所有东西都放在一个时,这曾经有用了 模块。我能看到的一个区别是我的所有包装类都是完全定义的 在core.pyx中,因为我不需要在模块之间共享它们。现在 我需要分享它们,所以我将它们分成.pyx和.pxd文件。
有人能指出我正确的方向吗?我已经搜过了Cython文档和谷歌 但到目前为止,我还没有找到任何可以回答我问题的内容。
谢谢,如果需要任何其他信息,请告诉我们!
答案 0 :(得分:0)
在扩展类型上访问c级函数需要cython知道确切的类型,否则它被视为通用Python对象。所以需要像这样的类型注释
cdef mod_one.PyRemoteDevice ret_val = ...