我在Swift中有一个函数来计算两个字符串的hamming distance,然后如果结果为1则将它们放入连接图中。
例如,读取到听取会返回汉明距离2,因为 read[0] != hear[0]
和 { {1}} 即可。
起初,我认为我的功能花了很长时间,因为输入的数量(8,000+单词字典),但我知道几分钟太长了。所以,我用Java重写了我的相同算法,计算只需0.3秒。
我尝试用两种不同的方式在Swift中写这个:
read[3] != hear[3]
结果: 434秒
extension String {
subscript (i: Int) -> String {
return self[Range(i ..< i + 1)]
}
}
private func getHammingDistance(w1: String, w2: String) -> Int {
if w1.length != w2.length { return -1 }
var counter = 0
for i in 0 ..< w1.length {
if w1[i] != w2[i] { counter += 1 }
}
return counter
}
结果: 156秒
结果: 0.3秒
private func getHammingDistance(w1: String, w2: String) -> Int {
if w1.length != w2.length { return -1 }
var counter = 0
var c1 = w1, c2 = w2 // need to mutate
let length = w1.length
for i in 0 ..< length {
if c1.removeFirst() != c2.removeFirst() { counter += 1 }
}
return counter
}
对我来说,156秒的效率仍然太低。在Swift中比较字符的绝对最有效的方法是什么?是否有可能的计算汉明距离的解决方法,而不是比较字符?
编辑1:我正在读一个包含4个和5个字母单词的完整字典,并创建一个连接图表,其中边缘表示汉明距离为1.因此,我将比较8,000多个单词另一个是生成边缘。
编辑2 已添加方法调用。
答案 0 :(得分:2)
试试这个:
extension String {
func hammingDistance(to other: String) -> Int? {
guard self.characters.count == other.characters.count else { return nil }
return zip(self.characters, other.characters).reduce(0) { distance, chars in
distance + (chars.0 == chars.1 ? 0 : 1)
}
}
}
print("read".hammingDistance(to: "hear")) // => 2
答案 1 :(得分:1)
以下代码以0.07分为单位执行8500个字符:
func getHammingDistance(w1: String, w2: String) -> Int {
if w1.characters.count != w2.characters.count {
return -1
}
let arr1 = Array(w1.characters)
let arr2 = Array(w2.characters)
var counter = 0
for i in 0 ..< arr1.count {
if arr1[i] != arr2[i] { counter += 1 }
}
return counter
}
答案 2 :(得分:1)
除非为字符串选择固定长度的字符模型,否则方法和属性(如.count和.characters)的复杂度为O(n)或最多为O(n / 2)(其中n为字符串长度) )。如果您要将数据存储在一个字符数组中(例如[Character]),那么您的函数会表现得更好。
您还可以使用zip()函数
在一次传递中组合整个计算let hammingDistance = zip(word1.characters,word2.characters)
.filter{$0 != $1}.count
但仍然需要遍历每个单词对的所有字符。
...
鉴于你只是寻找汉明距离为1,有一种更快捷的方式来获得所有独特的单词:
策略是按照与一个“缺失”字母对应的4(或5)个模式对单词进行分组。这些模式组中的每一个都定义了较小的单词对范围,因为不同组中的单词的距离不是1。
每个单词将属于与其字符数一样多的组。
例如:
"hear" will be part of the pattern groups:
"*ear", "h*ar", "he*r" and "hea*".
与这4个模式组中的一个对应的任何其他单词将与“听到”的汉明距离为1。
以下是如何实施:
// Test data 8500 words of 4-5 characters ...
var seenWords = Set<String>()
var allWords = try! String(contentsOfFile: "/usr/share/dict/words")
.lowercased()
.components(separatedBy:"\n")
.filter{$0.characters.count == 4 || $0.characters.count == 5}
.filter{seenWords.insert($0).inserted}
.enumerated().filter{$0.0 < 8500}.map{$1}
// Compute patterns for a Hamming distance of 1
// Replace each letter position with "*" to create patterns of
// one "non-matching" letter
public func wordH1Patterns(_ aWord:String) -> [String]
{
var result : [String] = []
let fullWord : [Character] = aWord.characters.map{$0}
for index in 0..<fullWord.count
{
var pattern = fullWord
pattern[index] = "*"
result.append(String(pattern))
}
return result
}
// Group words around matching patterns
// and add unique pairs from each group
func addHamming1Edges()
{
// Prepare pattern groups ...
//
var patternIndex:[String:Int] = [:]
var hamming1Groups:[[String]] = []
for word in allWords
{
for pattern in wordH1Patterns(word)
{
if let index = patternIndex[pattern]
{
hamming1Groups[index].append(word)
}
else
{
let index = hamming1Groups.count
patternIndex[pattern] = index
hamming1Groups.append([word])
}
}
}
// add edge nodes ...
//
for h1Group in hamming1Groups
{
for (index,sourceWord) in h1Group.dropLast(1).enumerated()
{
for targetIndex in index+1..<h1Group.count
{ addEdge(source:sourceWord, neighbour:h1Group[targetIndex]) }
}
}
}
在我的2012 MacBook Pro上,8500个单词在0.12秒内通过22817(独特)边缘对。
[编辑]为了说明我的第一点,我使用字符数组而不是字符串制作了一个“蛮力”算法:
let wordArrays = allWords.map{Array($0.unicodeScalars)}
for i in 0..<wordArrays.count-1
{
let word1 = wordArrays[i]
for j in i+1..<wordArrays.count
{
let word2 = wordArrays[j]
if word1.count != word2.count { continue }
var distance = 0
for c in 0..<word1.count
{
if word1[c] == word2[c] { continue }
distance += 1
if distance > 1 { break }
}
if distance == 1
{ addEdge(source:allWords[i], neighbour:allWords[j]) }
}
}
这通过0.27秒的独特对。速度差异的原因是Swift Strings的内部模型,它实际上不是等长元素(字符)的数组,而是一串不同长度的编码字符(类似于UTF模型,其中特殊字节表示以下2或3个字节是单个字符的一部分。没有简单的Base + Displacement索引这样的结构,必须始终从头开始迭代到第N个元素。
请注意,我使用unicodeScalars而不是Character,因为它们是16位固定长度的字符表示形式,允许直接二进制比较。字符类型不是那么简单,需要更长的时间进行比较。
答案 3 :(得分:1)
经过一番捣乱,我找到了一个更快的解决方案@ Alexander的回答(以及我之前的错误答案)
extension String {
func hammingDistance(to other: String) -> Int? {
guard !self.isEmpty, !other.isEmpty, self.characters.count == other.characters.count else {
return nil
}
var w1Iterator = self.characters.makeIterator()
var w2Iterator = other.characters.makeIterator()
var distance = 0;
while let w1Char = w1Iterator.next(), let w2Char = w2Iterator.next() {
distance += (w1Char != w2Char) ? 1 : 0
}
return distance
}
}
为了比较具有一百万个字符的字符串,在我的机器上它是1.078秒而不是1.220秒,因此大约提高了10%。我猜这是因为避免了.zip
以及.reduce
和元组的轻微开销
答案 4 :(得分:0)
*破*,见新答案
我的方法:
private func getHammingDistance(w1: String, w2: String) -> Int {
guard w1.characters.count == w2.characters.count else {
return -1
}
let countArray: Int = w1.characters.indices
.reduce(0, {$0 + (w1[$1] == w2[$1] ? 0 : 1)})
return countArray
}
比较2个10,000个随机字符的字符串需要0.31秒
要进行扩展:它应该只需要对字符串进行一次迭代,然后按原样添加。
此外,它更简洁。
答案 5 :(得分:0)
正如其他人所说,重复调用.characters需要时间。如果你将所有字符串转换一次,它应该有所帮助。
func connectData() {
let verticies = graph.canvas // canvas is Array<Node>
// Node has key that holds the String
// Convert all of the keys to utf16, and keep them
let nodesAsUTF = verticies.map { $0.key!.utf16 }
for vertex in 0 ..< verticies.count {
for compare in vertex + 1 ..< verticies.count {
if getHammingDistance(w1: nodesAsUTF[vertex], w2: nodesAsUTF[compare]) == 1 {
graph.addEdge(source: verticies[vertex], neighbor: verticies[compare])
}
}
}
}
// Calculate the hamming distance of two UTF16 views
func getHammingDistance(w1: String.UTF16View, w2: String.UTF16View) -> Int {
if w1.count != w2.count {
return -1
}
var counter = 0
for i in w1.startIndex ..< w1.endIndex {
if w1[i] != w1[i] {
counter += 1
}
}
return counter
}
我使用的是UTF16,但您可能需要尝试使用UTF8,具体取决于数据。由于我没有您正在使用的词典,请告诉我结果!