numpy.savez nonblocking i / o;可能?

时间:2017-08-28 21:02:29

标签: python numpy io cython

我有一些在Cython中运行的长时间运行,紧密循环,数字运算的OpenMP代码,但是我要回到python / numpy来编写检查点。我也在检查点中可视化中间结果,因此它们不会完全浪费。

我的壁钟时间经历了“Amdahl定律”减速,因为我无法弄清楚如何让numpy.savez(或它的堂兄,numpy.savez_compressed)进行非阻塞I / O.

我玩弄了尝试使用“多处理”或“多线程”与数字运算并行执行压缩和I / O的想法。 (我将剩下几个核心免费,因为这个盒子是我的主工作站。)

在我进入“曲折的迷宫之前,所有类似的:D”之前,我想我会问是否有人已经从(I)Python / Numpy / Cython生态系统中找到了解决此类问题的干净解决方案。 / p>

提前感谢您提供的任何建议!

Frank Horowitz

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