来自HDFS的SystemML加载文件?

时间:2017-08-23 08:38:39

标签: apache-spark systemml

如何从systemML DSL中的HDFS加载csv文件?

我试过像:

X = read("hdfs://ip-XXX-XXX-XXX-XXX:9000/SystemML/data/NN_X_100_10.csv");

我检查过该文件实际上位于此HDFS位置。

当我运行dsl时:

 $SPARK_HOME/bin/spark-submit ~/Nearest_Neighbour_Search/SystemML/systemml-0.14.0-incubating.jar -f ~/Nearest_Neighbour_Search/SystemML/Task03_NN_SystemML_1000_hdfs.dml

它抱怨说:

ERROR:/home/ubuntu/Nearest_Neighbour_Search/SystemML/Task03_NN_SystemML_1000_hdfs.dml -- line 1, column 0 -- Read input file does not exist on FS (local mode): hdfs://ip-172-30-4-168:9000/SystemML/data/NN_X_1000000_1000.csv
        at org.apache.sysml.api.DMLScript.executeScript(DMLScript.java:367)
        at org.apache.sysml.api.DMLScript.main(DMLScript.java:214)
        at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
        at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
        at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
        at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
        at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit$.org$apache$spark$deploy$SparkSubmit$$runMain(SparkSubmit.scala:738)
        at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit$.doRunMain$1(SparkSubmit.scala:187)
        at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit$.submit(SparkSubmit.scala:212)
        at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit$.main(SparkSubmit.scala:126)
        at org.apache.spark.deploy.SparkSubmit.main(SparkSubmit.scala)
    Caused by: org.apache.sysml.parser.LanguageException: Invalid Parameters : ERROR: /home/ubuntu/Nearest_Neighbour_Search/SystemML/Task03_NN_SystemML_1000_hdfs.dml -- line 1, column 0 -- Read input file does not exist on FS (local mode): hdfs://ip-172-30-4-168:9000/SystemML/data/NN_X_1000000_1000.csv
        at org.apache.sysml.parser.Expression.raiseValidateError(Expression.java:549)
        at org.apache.sysml.parser.DataExpression.validateExpression(DataExpression.java:641)
        at org.apache.sysml.parser.StatementBlock.validate(StatementBlock.java:592)
        at org.apache.sysml.parser.DMLTranslator.validateParseTree(DMLTranslator.java:143)
        at org.apache.sysml.api.DMLScript.execute(DMLScript.java:591)
        at org.apache.sysml.api.DMLScript.executeScript(DMLScript.java:353)
        ... 10 more

我认为问题与本地模式有关,但我不知道如何设置支持systemFS的HDFS。

任何建议都非常感谢!

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您是对的,它与本地模式有关,更具体地说是默认文件系统实现(即core-site.xml中的fs.defaultFS)。 SystemML 0.14(以及之前的版本,请参阅https://issues.apache.org/jira/browse/SYSTEMML-1664)中存在一个错误,该错误导致所有本地读取使用独立于指定文件方案的已配置的默认FS实现。 hadoop jar包含使用本地模式和本地文件系统实现的默认配置。

这里有两个选项:

  1. 升级:由于此错误已在SystemML master中修复(因此任何即将推出的版本),您可以从头开始构建或使用现有的快照工件(https://repository.apache.org/content/groups/snapshots/org/apache/systemml/systemml/1.0.0-SNAPSHOT/systemml-1.0.0-20170818.213422-9.jar)。
  2. 解决方法:作为一种变通方法,您可以将csv文件放入本地文件系统,只需在read语句中使用相对或绝对文件路径。